75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0569 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  62.44 
 
 
646 aa  792    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  62.89 
 
 
646 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  62.36 
 
 
636 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  91.72 
 
 
640 aa  1198    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  57.68 
 
 
629 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  58.56 
 
 
626 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  59.72 
 
 
629 aa  736    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  59.72 
 
 
629 aa  737    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  100 
 
 
640 aa  1307    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  26.55 
 
 
630 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.55 
 
 
617 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  25.11 
 
 
628 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.46 
 
 
594 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  28.18 
 
 
662 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  25.08 
 
 
628 aa  127  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  24.44 
 
 
597 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  24.44 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  26.59 
 
 
647 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  26.75 
 
 
656 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  23.91 
 
 
656 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  26.25 
 
 
656 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  26.56 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  23.79 
 
 
584 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.2 
 
 
641 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.7 
 
 
629 aa  74.3  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  27.09 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  21.85 
 
 
684 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  29.13 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.71 
 
 
319 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  22.82 
 
 
664 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  21.32 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  29.2 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  30.18 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  24.14 
 
 
317 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  24.61 
 
 
284 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  26.01 
 
 
309 aa  64.7  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  26.77 
 
 
309 aa  63.9  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  30.43 
 
 
454 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.74 
 
 
774 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  23.82 
 
 
317 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 
329 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 
329 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  27.11 
 
 
347 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  22.7 
 
 
658 aa  54.7  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  28.34 
 
 
1025 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  26.57 
 
 
353 aa  53.5  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  26.67 
 
 
316 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.84 
 
 
330 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  28.21 
 
 
1068 aa  51.2  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  26.26 
 
 
341 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  23.26 
 
 
1012 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  26.33 
 
 
339 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  26.94 
 
 
488 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  27.3 
 
 
347 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  23.77 
 
 
983 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  25.97 
 
 
1222 aa  47.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  21.11 
 
 
723 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0498  lipolytic protein G-D-S-L family  26.99 
 
 
347 aa  47.4  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal  0.126404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  27.13 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  22.22 
 
 
1016 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  24.25 
 
 
418 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  24.29 
 
 
1011 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  24.65 
 
 
1677 aa  45.8  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  25.11 
 
 
1508 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3964  GDSL family lipase  25 
 
 
366 aa  45.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0535  hypothetical protein  23.48 
 
 
315 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  20.81 
 
 
939 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  26.64 
 
 
763 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  27.37 
 
 
1001 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  24.42 
 
 
516 aa  44.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  28.93 
 
 
759 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  24.42 
 
 
516 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  21.07 
 
 
972 aa  44.3  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.08 
 
 
972 aa  44.3  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  27.51 
 
 
637 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>