More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0495 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
396 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  94.95 
 
 
396 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  84.85 
 
 
392 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.28 
 
 
390 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  82.56 
 
 
390 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.9 
 
 
401 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.38 
 
 
401 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  82.31 
 
 
390 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  79.18 
 
 
391 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  81.54 
 
 
390 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  78.04 
 
 
389 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  60 
 
 
397 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.66 
 
 
386 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.63 
 
 
392 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.18 
 
 
394 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1126  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.98 
 
 
387 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1130  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.44 
 
 
396 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.07 
 
 
391 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.94 
 
 
403 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2288  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.84 
 
 
393 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.50363  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.35 
 
 
387 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.53 
 
 
397 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.79 
 
 
387 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1166  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.55 
 
 
386 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.609374  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0962  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.87 
 
 
402 aa  336  5e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0636992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.03 
 
 
385 aa  318  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.83 
 
 
383 aa  318  7.999999999999999e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2163  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.78 
 
 
399 aa  315  7e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1923  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.6 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00136658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4032  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.37 
 
 
410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1267  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.21 
 
 
384 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123615  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3642  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.98 
 
 
408 aa  308  8e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2556  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.38 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00135119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0320  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.27 
 
 
386 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569428  normal  0.0137609 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0934  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.37 
 
 
384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0922  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.48 
 
 
385 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.04 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0890  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.48 
 
 
385 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.866629  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1041  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.11 
 
 
384 aa  302  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.29 
 
 
385 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0628  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.16 
 
 
401 aa  302  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.21 
 
 
385 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000743948  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0710  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.16 
 
 
401 aa  302  9e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0945  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.21 
 
 
385 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0094418  normal  0.966825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0115  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 
406 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.257966  normal  0.744496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.68 
 
 
389 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.95 
 
 
385 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.123721  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  41.8 
 
 
393 aa  299  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.58 
 
 
389 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.53 
 
 
391 aa  295  6e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1832  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
405 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.03 
 
 
391 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4264  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.17 
 
 
394 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.25 
 
 
382 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0247  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.09 
 
 
392 aa  293  4e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0631  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.08 
 
 
384 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00112054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.87 
 
 
384 aa  292  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.15 
 
 
384 aa  292  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.15 
 
 
384 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.87 
 
 
384 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02875  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.84 
 
 
379 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.15 
 
 
384 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
384 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
384 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  48.59 
 
 
384 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.59 
 
 
384 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0154  8-amino-7-oxononanoate synthase  43.65 
 
 
411 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0898  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.4 
 
 
405 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0446  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.62 
 
 
394 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.11 
 
 
395 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1312  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.56 
 
 
383 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1579  8-amino-7-oxononanoate synthase  50 
 
 
405 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207826  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0530  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.74 
 
 
396 aa  285  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.730891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1372  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.91 
 
 
415 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.134715  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.67 
 
 
391 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0172  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.63 
 
 
394 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  43.09 
 
 
395 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.32 
 
 
383 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0148  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.22 
 
 
408 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.69 
 
 
395 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2595  putative 7-keto-8-aminopelargonic acid synthetase  38.92 
 
 
382 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.855243  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.77 
 
 
389 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.77 
 
 
389 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0573  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
394 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1478  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.12 
 
 
416 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0815886  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0411  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
394 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.955865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  41.36 
 
 
396 aa  278  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0101  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
394 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2271  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
394 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0390  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
394 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3079  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
394 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2015  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.05 
 
 
394 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0168  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.59 
 
 
411 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  44 
 
 
391 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.4 
 
 
396 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3828  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.42 
 
 
407 aa  276  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02210  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.05 
 
 
466 aa  275  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.63523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.93 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0339  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.32 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2843  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.06 
 
 
383 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>