26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0482 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000043148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1311  hypothetical protein  53.26 
 
 		 94 aa  104  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328492  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0352  hypothetical protein  47.25 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0040  hypothetical protein  50.56 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0311  hypothetical protein  52.22 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.34678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2961  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0295  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2964  Fis family transcriptional regulator  54.22 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7032  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00925543  normal  0.081206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3471  hypothetical protein  60.44 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4064  hypothetical protein  59.78 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1854  hypothetical protein  59.78 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703432  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3584  hypothetical protein  59.78 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3340  hypothetical protein  58.7 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.652813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4177  hypothetical protein  57.61 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4190  hypothetical protein  57.61 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0607  hypothetical protein  52.13 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0655  hypothetical protein  51.65 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0156  hypothetical protein  51.06 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1002  hypothetical protein  46.74 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0256071 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1578  hypothetical protein  49.47 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4454  transcriptional regulator, Fis family  52.75 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121305  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3974  Fis family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1498  hypothetical protein  43.94 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.743357  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3662  protein of unknown function UPF0150  29.51 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>