More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0361 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  72.43 
 
 		 607 aa  895    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  72.43 
 
 		 607 aa  895    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  71.43 
 
 		 606 aa  904    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  58.26 
 
 		 598 aa  697    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  91.42 
 
 		 606 aa  1147    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  61.82 
 
 		 605 aa  769    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 615 aa  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  65.89 
 
 		 606 aa  818    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  60.99 
 
 		 608 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  61.5 
 
 		 606 aa  744    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  55.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  66.33 
 
 		 605 aa  835    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  55.57 
 
 		 602 aa  677    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  55.39 
 
 		 613 aa  678    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  60.83 
 
 		 608 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  68.99 
 
 		 603 aa  849    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 606 aa  1236    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  55.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  55.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  52.08 
 
 		 615 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  55.89 
 
 		 614 aa  681    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  60.83 
 
 		 608 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  65.23 
 
 		 608 aa  816    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  65.18 
 
 		 608 aa  818    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  96.86 
 
 		 606 aa  1204    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  70.54 
 
 		 615 aa  879    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  58.42 
 
 		 613 aa  718    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  55.46 
 
 		 602 aa  665    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  57.76 
 
 		 599 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  60.6 
 
 		 606 aa  741    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  78.61 
 
 		 603 aa  991    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  59.9 
 
 		 610 aa  751    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  67.5 
 
 		 609 aa  825    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  68.1 
 
 		 607 aa  845    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  60.83 
 
 		 608 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  67.11 
 
 		 609 aa  840    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  91.72 
 
 		 606 aa  1145    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  79.8 
 
 		 605 aa  1001    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 602 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  59.44 
 
 		 608 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  68.5 
 
 		 603 aa  839    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  69.54 
 
 		 609 aa  859    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  70.46 
 
 		 607 aa  884    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  52.08 
 
 		 615 aa  653    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  58.1 
 
 		 598 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  60.83 
 
 		 608 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  65.95 
 
 		 607 aa  828    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  55.89 
 
 		 614 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0006  GTP-binding protein TypA  51.9 
 
 		 600 aa  639    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  67.5 
 
 		 609 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  57.81 
 
 		 610 aa  705    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  61.42 
 
 		 603 aa  769    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 602 aa  679    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  58.35 
 
 		 607 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  79.5 
 
 		 606 aa  991    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  60.66 
 
 		 608 aa  746    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.62 
 
 		 614 aa  651    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  91.25 
 
 		 606 aa  1146    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 614 aa  662    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000155128  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3380  GTP-binding protein TypA  57.99 
 
 		 608 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465428  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  68.54 
 
 		 604 aa  847    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2137  GTP-binding protein TypA  57.36 
 
 		 607 aa  703    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  72.79 
 
 		 608 aa  910    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  60.83 
 
 		 608 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  60.96 
 
 		 602 aa  734    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  57.69 
 
 		 607 aa  702    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  60.26 
 
 		 608 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  68.5 
 
 		 603 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  58.8 
 
 		 601 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  70.89 
 
 		 608 aa  895    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  57.57 
 
 		 609 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  69.56 
 
 		 615 aa  870    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  61.32 
 
 		 607 aa  745    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  53.42 
 
 		 605 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.74 
 
 		 593 aa  655    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2746  GTP-binding protein TypA  56.18 
 
 		 607 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.163334  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  70.28 
 
 		 615 aa  868    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  59.77 
 
 		 608 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  68.5 
 
 		 623 aa  860    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  60 
 
 		 605 aa  730    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  68.38 
 
 		 607 aa  850    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 		 610 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 		 610 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  69.38 
 
 		 616 aa  846    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  60.99 
 
 		 608 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  68.49 
 
 		 603 aa  844    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  68.49 
 
 		 603 aa  844    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  67.5 
 
 		 602 aa  845    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  67.67 
 
 		 603 aa  835    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  64.13 
 
 		 608 aa  812    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  59.44 
 
 		 608 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  81.14 
 
 		 605 aa  1016    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2298  membrane GTPase for stress response  53.4 
 
 		 613 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0807  stress response membrane GTPase  51.65 
 
 		 611 aa  639    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0319085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1181  stress response membrane GTPase  52.74 
 
 		 618 aa  652    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0076831  hitchhiker  0.00656826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1342  stress response membrane GTPase  51.99 
 
 		 613 aa  638    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0910775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  56.79 
 
 		 615 aa  689    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  59.77 
 
 		 608 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  64.74 
 
 		 611 aa  805    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  68.82 
 
 		 603 aa  851    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>