More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0329 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0247  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.39 
 
 		 437 aa  752    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.69504  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.39 
 
 		 437 aa  752    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.33726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0329  osmolarity sensor protein EnvZ  100 
 
 		 440 aa  885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4965  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 437 aa  741    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0259  sensor histidine kinase  98.41 
 
 		 440 aa  871    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5943  two-component sensor EnvZ  77.7 
 
 		 439 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.5 
 
 		 437 aa  746    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0261  osmolarity sensor protein envZ  87.87 
 
 		 437 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0360  osmolarity sensor protein envZ  80.37 
 
 		 438 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05130  osmolarity-sensing histidine protein kinase, EnvZ  78.49 
 
 		 437 aa  664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68680  two-component sensor EnvZ  78.4 
 
 		 439 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0226  osmolarity sensor protein  36.87 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3539  osmolarity sensor protein  41.91 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0217  osmolarity sensor protein  41.76 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  36.04 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4135  osmolarity sensor protein  36.26 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  41.18 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  40.52 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4634  osmolarity sensor protein  40.29 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0149  osmolarity sensor protein  40.46 
 
 		 436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4339  osmolarity sensor protein  40.46 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4018  osmolarity sensor protein  35.59 
 
 		 438 aa  243  7e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0167  osmolarity sensor protein  40 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.642764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4207  osmolarity sensor protein  36.04 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4596  osmolarity sensor protein  35.25 
 
 		 430 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115572  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3812  osmolarity sensor protein  35.36 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.02572 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3903  osmolarity sensor protein  35.73 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0203  osmolarity sensor protein  38.07 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03948  osmolarity sensor protein  32.89 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3511  osmolarity sensor protein  33.26 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.407552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2020  signal transduction histidine kinase sensor  32.75 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001869  osmolarity sensory histidine kinase EnvZ  36.81 
 
 		 430 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00622  osmolarity sensor protein  34.06 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0245  osmolarity sensor protein  35.35 
 
 		 470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3979  osmolarity sensor protein  33.63 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.413439  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0173  osmolarity sensor protein  33.63 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3740  osmolarity sensor protein  33.63 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2323  histidine kinase  32.31 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.414368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0325  osmolarity sensor protein  34.29 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.48379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03256  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2285  osmolarity sensor protein  36.81 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0653  histidine kinase  37.82 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.303761  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0309  histidine kinase  34.16 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3601  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4710  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.570266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3878  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0309  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0583952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3774  osmolarity sensor protein  33.56 
 
 		 447 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3870  osmolarity sensor protein  33.78 
 
 		 447 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.671059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3808  osmolarity sensor protein  33.78 
 
 		 447 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3699  osmolarity sensor protein  33.78 
 
 		 447 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3702  osmolarity sensor protein  33.78 
 
 		 447 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3685  osmolarity sensor protein  34.16 
 
 		 450 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3783  osmolarity sensor protein  33.94 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 486 aa  209  5e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal  0.0855342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3817  osmolarity sensor protein  34.38 
 
 		 448 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3897  osmolarity sensor protein  34.62 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4074  osmolarity sensor protein  34.4 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4620  osmolarity sensor protein  34.62 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2058  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 451 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0391  sensor histidine kinase  37.43 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.784446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1647  oxidative stress resistance two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.65 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1570  histidine kinase  38.82 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.115391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1899  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558048  normal  0.259205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3882  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0751  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  37.93 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3024  putative osmolarity sensor protein EnvZ  37.93 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0994  putative osmolarity sensor protein EnvZ  37.93 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1573  putative osmolarity sensor protein EnvZ  37.93 
 
 		 437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.311339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1367  sensor histidine kinase  37.87 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1253  signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2404  histidine kinase  37.87 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172999  hitchhiker  0.00719828 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1100  sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1095  sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 438 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 449 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 439 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5727  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 438 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0894  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  36.89 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3386  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 439 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2403  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1979  sensor histidine kinase  34.35 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.690956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  41.73 
 
 		 471 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  33.05 
 
 		 454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1332  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152315  decreased coverage  0.000105816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528323  hitchhiker  0.00000143015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2093  sensor histidine kinase RisS  34.6 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.884804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000286797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0574  sensor histidine kinase  32.46 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000108072  hitchhiker  0.00000487933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2581  histidine kinase  35.92 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0578515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0372  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.8 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.919745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1734  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.752301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>