More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0301 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  74.11 
 
 		 426 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  73.46 
 
 		 426 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  85.68 
 
 		 425 aa  749    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0301  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 426 aa  861    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2972  4-aminobutyrate aminotransferase  74.41 
 
 		 427 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109466  normal  0.025416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2937  4-aminobutyrate aminotransferase  74.64 
 
 		 427 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2782  4-aminobutyrate aminotransferase  74.11 
 
 		 426 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.480055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0090  4-aminobutyrate aminotransferase  97.65 
 
 		 426 aa  804    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4998  4-aminobutyrate aminotransferase  85.68 
 
 		 425 aa  725    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  85.68 
 
 		 425 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  85.45 
 
 		 425 aa  748    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0188  4-aminobutyrate aminotransferase  89.65 
 
 		 425 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2905  4-aminobutyrate aminotransferase  75.12 
 
 		 427 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2797  4-aminobutyrate aminotransferase  73.4 
 
 		 426 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  73.4 
 
 		 426 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  77.23 
 
 		 440 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2989  4-aminobutyrate aminotransferase  74.41 
 
 		 427 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0883038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  78.4 
 
 		 426 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  78.64 
 
 		 426 aa  696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  74.11 
 
 		 426 aa  651    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2942  4-aminobutyrate aminotransferase  73.16 
 
 		 426 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  74.11 
 
 		 426 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46670  4-aminobutyrate transaminase  77.93 
 
 		 426 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1114  4-aminobutyrate aminotransferase  71.56 
 
 		 425 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1172  4-aminobutyrate aminotransferase  71.33 
 
 		 425 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.408586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1205  4-aminobutyrate aminotransferase  71.33 
 
 		 425 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.60622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1100  4-aminobutyrate aminotransferase  70.85 
 
 		 425 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.840531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3186  4-aminobutyrate aminotransferase  70.85 
 
 		 425 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.365354  normal  0.0629171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0910  4-aminobutyrate aminotransferase  70.59 
 
 		 425 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000169324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3003  4-aminobutyrate aminotransferase  70.12 
 
 		 424 aa  594  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2636  4-aminobutyrate aminotransferase  70.85 
 
 		 425 aa  594  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  68.26 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  72.51 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.51273  normal  0.448199 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2994  4-aminobutyrate aminotransferase  72.51 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.235499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0952  4-aminobutyrate aminotransferase  69.93 
 
 		 425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3091  4-aminobutyrate aminotransferase  71.8 
 
 		 425 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0318031  normal  0.465218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1276  4-aminobutyrate aminotransferase  70.85 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  66.11 
 
 		 430 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  64.37 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2912  4-aminobutyrate aminotransferase  65.4 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0429  4-aminobutyrate aminotransferase  62.44 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  59.48 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  57.98 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  58.13 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  57.55 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  57.11 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  58.02 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  57.55 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  58.33 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  57.08 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  57.08 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  57.62 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  56.19 
 
 		 427 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  57.14 
 
 		 426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  57.38 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  57.38 
 
 		 426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  56.22 
 
 		 421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  55.95 
 
 		 421 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  55.9 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4026  4-aminobutyrate aminotransferase  57.45 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4356  4-aminobutyrate aminotransferase  58.41 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1784  4-aminobutyrate aminotransferase  58.1 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  57.62 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  53.41 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3928  (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase  55.66 
 
 		 427 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  55.8 
 
 		 421 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  55.34 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  55.34 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  55.34 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  53.3 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  55.48 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6300  4-aminobutyrate aminotransferase  56.53 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4677  4-aminobutyrate aminotransferase  57.42 
 
 		 422 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300302  normal  0.0763833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  55.34 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  55.34 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  56.19 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  55.11 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  54.63 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  54.87 
 
 		 421 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2259  4-aminobutyrate aminotransferase  54.72 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.418729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  55.11 
 
 		 421 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7694  4-aminobutyrate aminotransferase  55.98 
 
 		 426 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.788415  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  55.26 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0809  4-aminobutyrate aminotransferase  53.49 
 
 		 419 aa  448  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.615332  normal  0.0671712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  50.96 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0819  4-aminobutyrate aminotransferase  53.73 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.798552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1867  4-aminobutyrate aminotransferase  55.82 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  54.85 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2119  4-aminobutyrate aminotransferase  57.24 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3070  4-aminobutyrate aminotransferase  55.02 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3862  4-aminobutyrate aminotransferase  55.66 
 
 		 427 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.612157 
 
 
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NC_003910  CPS_4664  4-aminobutyrate aminotransferase  54.8 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1480  4-aminobutyrate aminotransferase  57.01 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285314  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A0810  4-aminobutyrate transaminase  57.01 
 
 		 427 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.622888  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_3494  4-aminobutyrate aminotransferase  55.21 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.782932  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1532  4-aminobutyrate aminotransferase  53.25 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0494  4-aminobutyrate transaminase  56.77 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141268  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2567  4-aminobutyrate aminotransferase  54.03 
 
 		 424 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78639  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_2127  4-aminobutyrate transaminase  56.77 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  54.46 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
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