261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0299 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  100 
 
 		 351 aa  706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  92.31 
 
 		 467 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  54.17 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  50.89 
 
 		 408 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  44.44 
 
 		 397 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  43.26 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  42.74 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  43.43 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  42.24 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  41.94 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  34.44 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  38.73 
 
 		 400 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  34.17 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  34.17 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  34.65 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  35.39 
 
 		 407 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  34.17 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  31.64 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  35.01 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  31.58 
 
 		 423 aa  159  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  37.21 
 
 		 400 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.62 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  34.09 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  34.94 
 
 		 374 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  33.61 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  32.35 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  34.48 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  31.53 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  34.98 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  31.4 
 
 		 496 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  32.63 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  37.27 
 
 		 387 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  30.97 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  29.09 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  28.01 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  38.26 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  31.83 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  32.99 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  33.23 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  34.27 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  27.22 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  27.27 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  29.96 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  30.49 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  28.27 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  30.64 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 		 388 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  34.14 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  27.6 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  30.8 
 
 		 386 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  31.45 
 
 		 392 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.6 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  30.42 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.57 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.43 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  28.05 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  31.95 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  29.33 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  24.08 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  30.37 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.06 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.14 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.77 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.46 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  31.27 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.63 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  30.34 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  28.91 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.47 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  32.7 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  27.76 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14452  predicted protein  27.87 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.97 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.62 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  29.79 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.18 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  28.81 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  29.73 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  24.69 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  28.03 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  30.25 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.25 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2199  hypothetical protein  29.96 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0226443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  27.27 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  31.58 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0544  hypothetical protein  28.06 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  27.53 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.18 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  28.63 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0501  hypothetical protein  25.84 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.63 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>