178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0262 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  72.3 
 
 		 152 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  56.58 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  51.35 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  47.92 
 
 		 150 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  46.31 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  44.22 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  46.62 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  48.3 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  47.62 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  45.14 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  46.26 
 
 		 151 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  49.62 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  46.53 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  44.53 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  42.86 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  39.58 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  44.68 
 
 		 150 aa  117  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  46.51 
 
 		 86 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  32.39 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  34.11 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  33.85 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  25.53 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  27.97 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  27.97 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  25.53 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  30.83 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  25.58 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  27.86 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  29.32 
 
 		 305 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  29.45 
 
 		 239 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  28.91 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  27.87 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  27.07 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  25.2 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  27.21 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  28.68 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  25.48 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  25.35 
 
 		 255 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  30.59 
 
 		 323 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  29.41 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  24.64 
 
 		 338 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  26.43 
 
 		 335 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  25.93 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  29.51 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  25.74 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  25.55 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  27.78 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  34.67 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  30.59 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  29.51 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  25.74 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  29.51 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  24.1 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.98 
 
 		 322 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.84 
 
 		 1345 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  22.63 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  23.19 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  36.84 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  26.87 
 
 		 312 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  26.71 
 
 		 223 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  26.67 
 
 		 216 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  23.7 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  28.35 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.77 
 
 		 1372 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  22.53 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  24.6 
 
 		 314 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  24.81 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  27.07 
 
 		 340 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  26.72 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  30.23 
 
 		 326 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  27.21 
 
 		 180 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  24.53 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 		 323 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  25 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  26.86 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  22.96 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  30.68 
 
 		 323 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  28.1 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  24.05 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  26.19 
 
 		 312 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  24.88 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  22.96 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  22.96 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  26.23 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  24.46 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  21.01 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  23.68 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  25 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  23.88 
 
 		 191 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  23.42 
 
 		 219 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  26.95 
 
 		 335 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0231  protein of unknown function DUF1568  30.77 
 
 		 298 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  27.56 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  25.4 
 
 		 316 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>