More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0144 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  52.64 
 
 		 685 aa  707    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  59.06 
 
 		 680 aa  811    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  59.06 
 
 		 680 aa  813    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  58.91 
 
 		 680 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  89.02 
 
 		 683 aa  1247    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  51.69 
 
 		 676 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  48.21 
 
 		 677 aa  678    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  59.14 
 
 		 682 aa  818    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  48.99 
 
 		 706 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  58.62 
 
 		 680 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  52.06 
 
 		 683 aa  755    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  56.19 
 
 		 682 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  58.62 
 
 		 680 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  50.59 
 
 		 677 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  60.24 
 
 		 679 aa  822    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  100 
 
 		 683 aa  1407    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 699 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  48.62 
 
 		 683 aa  684    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  49.33 
 
 		 685 aa  681    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  97.51 
 
 		 683 aa  1351    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0078  oligopeptidase A  49.85 
 
 		 741 aa  644    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3646  oligopeptidase A  50.44 
 
 		 684 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  59.2 
 
 		 680 aa  814    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  49.06 
 
 		 692 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  48.64 
 
 		 701 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 704 aa  676    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3493  Oligopeptidase A  51.84 
 
 		 676 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161675  normal  0.315797 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 699 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  57.79 
 
 		 679 aa  800    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  56.34 
 
 		 680 aa  783    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  91.51 
 
 		 692 aa  1278    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 699 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  49.78 
 
 		 695 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  56.34 
 
 		 680 aa  783    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  59.06 
 
 		 680 aa  813    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  55.05 
 
 		 683 aa  751    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  59.06 
 
 		 680 aa  813    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  58.62 
 
 		 680 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  89.02 
 
 		 695 aa  1247    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  50.14 
 
 		 703 aa  674    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  49.21 
 
 		 704 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  50.14 
 
 		 700 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2614  oligopeptidase A  48.63 
 
 		 685 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  60.29 
 
 		 679 aa  822    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  59.65 
 
 		 679 aa  819    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  58.91 
 
 		 680 aa  809    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 699 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  49.41 
 
 		 679 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  56.56 
 
 		 685 aa  769    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  58.62 
 
 		 680 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  51.91 
 
 		 679 aa  704    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  57.61 
 
 		 678 aa  809    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  50.43 
 
 		 716 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  59.79 
 
 		 679 aa  820    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  49.57 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  58.55 
 
 		 679 aa  808    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  55.52 
 
 		 695 aa  775    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  56.29 
 
 		 694 aa  770    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  48.93 
 
 		 712 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0084  oligopeptidase A  51.07 
 
 		 731 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.611624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  48.63 
 
 		 700 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  51.19 
 
 		 695 aa  712    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  48.36 
 
 		 677 aa  680    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  58.11 
 
 		 680 aa  806    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  49.93 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  49.57 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  60.24 
 
 		 679 aa  824    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  85.48 
 
 		 681 aa  1182    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  56.13 
 
 		 680 aa  800    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  57 
 
 		 680 aa  805    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  54.79 
 
 		 679 aa  778    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  51.77 
 
 		 674 aa  669    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  81.96 
 
 		 682 aa  1176    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  59.5 
 
 		 679 aa  815    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  59.06 
 
 		 680 aa  813    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  60.38 
 
 		 679 aa  825    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  49.42 
 
 		 695 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  58.92 
 
 		 676 aa  823    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  58.47 
 
 		 679 aa  799    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  60.09 
 
 		 679 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  57.06 
 
 		 679 aa  793    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  89.17 
 
 		 695 aa  1250    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  49.71 
 
 		 702 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  58.91 
 
 		 679 aa  818    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 699 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  50.65 
 
 		 695 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  85.34 
 
 		 681 aa  1204    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0702  Oligopeptidase A  48.13 
 
 		 712 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.713847  normal  0.266777 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  49.57 
 
 		 695 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  60.38 
 
 		 679 aa  827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 699 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  56.64 
 
 		 680 aa  791    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  60.38 
 
 		 679 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  50.36 
 
 		 699 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  48.91 
 
 		 679 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  90.34 
 
 		 695 aa  1262    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  59.73 
 
 		 679 aa  813    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  58.55 
 
 		 678 aa  811    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  55.13 
 
 		 683 aa  769    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  56.3 
 
 		 681 aa  801    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>