274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0011 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  31.11 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  34.27 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  33.87 
 
 
244 aa  105  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  30.26 
 
 
242 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  30.62 
 
 
227 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  29.67 
 
 
227 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 
241 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  30.39 
 
 
226 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  27.95 
 
 
245 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  29.18 
 
 
261 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  27.07 
 
 
243 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  32.61 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  32.5 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  28.92 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  28.43 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  30.35 
 
 
241 aa  92  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  28.38 
 
 
224 aa  92  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  28.18 
 
 
244 aa  91.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  31.1 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  29.46 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  24.89 
 
 
238 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  27.18 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.86 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  33.49 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  24.55 
 
 
211 aa  86.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  23.88 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  27.1 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  26.75 
 
 
254 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  26.86 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  37.5 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  29.61 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.61 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  30.73 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  31.07 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.84 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  31.08 
 
 
227 aa  82  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  28.72 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  23.68 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  26.05 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  32.08 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  36.89 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  34.4 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  30.65 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  24.42 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  24.39 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  25.99 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  23.38 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  25.48 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  26.9 
 
 
270 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  25.47 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  27.67 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  25.47 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  25.64 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  24.22 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  24.74 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  25.6 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  23.3 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  29.94 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  24.84 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  22.17 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  24.84 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  24.84 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.63 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  24.84 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  27.12 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  25.31 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0788  protein of unknown function DUF45  32 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  28.71 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  24.84 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  38.46 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  23.3 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  24.86 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  34.58 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  28.24 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  28.16 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  23.81 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  28.31 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  26.37 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  25.1 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  22.4 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  24.04 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  29.69 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  30.77 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  32.32 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  26.16 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  29.85 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2552  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2986  conserved hypothetical protein DUF45  33.15 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  34.62 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  24.73 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  25.26 
 
 
301 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2109  protein of unknown function DUF45  34.41 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  25.67 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1474  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360877  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  27.43 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>