74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0057 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  46.67 
 
 		 94 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  48.89 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  46.15 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  46.67 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  46.67 
 
 		 89 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  43.96 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  42.86 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  46.15 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.05 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  41.3 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  45.65 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  45.05 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  47.3 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  37.78 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  43.48 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  39.33 
 
 		 101 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  38.71 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  43.48 
 
 		 94 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  38.04 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  38.04 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  37.78 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.78 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  42.7 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  36.05 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  36.26 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.94 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  35.16 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  34.78 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.82 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.22 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  34.07 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  35.16 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  34.07 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.22 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  36.49 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4125  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000028611  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  38.04 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  36.96 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.7 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  33.75 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  34.44 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  32.58 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  41.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6483  addiction module antitoxin  32.26 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14116  normal  0.517608 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  30.77 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2332  plasmid stabilization system protein  32.22 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  29.76 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.37 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0543  putative plasmid stabilisation system protein  35.87 
 
 		 104 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  34.09 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.12 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  29.07 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.77 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  23.66 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  31.25 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  47.62 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  42.37 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>