More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0008 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  35.8 
 
 		 369 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  40.11 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  40 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  41.18 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  31.02 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  29.2 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  35.53 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6163  ParB family protein  40.25 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  40.94 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  37.57 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  40 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  37.81 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  40 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.08 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  35.38 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  34.52 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  41.29 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  36.17 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  40.69 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  28.51 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.64 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  40.12 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  33.72 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  41.4 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  28.93 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  36.88 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  36.32 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  36.32 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  36.32 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  36.32 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  34.15 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.1 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  36.32 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  38.31 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  35.79 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  36.32 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  33.82 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  33.82 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  33.05 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  32.29 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  36.32 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  31.48 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  40.41 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  40.97 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  33.82 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  35.85 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  35.85 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  37.66 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  35.64 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  33.49 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  31.84 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  35.38 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  36.42 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  34.95 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  34.18 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  42.25 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  36.46 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  32.29 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  35.68 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  39.04 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  35.62 
 
 		 279 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  39.04 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  34.47 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  37.11 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  36.63 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  38.33 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  34.16 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2755  parB-like partition protein  38.1 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.66 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  31.08 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  33.5 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  35.03 
 
 		 282 aa  95.9  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2942  parB-like partition protein  34.36 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  35.88 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  34.59 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  35.57 
 
 		 334 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  38.1 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  36.63 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  36.63 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  36.63 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  32.42 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  34.47 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  33.96 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  34.12 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1370  ParB family protein  36.6 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  34.47 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  38.67 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2731  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  32.99 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  33.02 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  33.18 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  39.73 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  34.01 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0081  chromosome segregation DNA-binding protein  40.14 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  35.75 
 
 		 362 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>