100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6287 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  550  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  96.69 
 
 		 292 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  82.56 
 
 		 286 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  85.94 
 
 		 284 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  85.94 
 
 		 284 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  85.54 
 
 		 284 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  82.42 
 
 		 290 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  85.54 
 
 		 284 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  80.3 
 
 		 292 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  82.06 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  80.23 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.37 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.88 
 
 		 276 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.26 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.6 
 
 		 277 aa  262  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.8 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  50.4 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.37 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.94 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.53 
 
 		 245 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.77 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.94 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  44.13 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.28 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.76 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.42 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.06 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  27.92 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.76 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.3 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.07 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.19 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.49 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.26 
 
 		 287 aa  52.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.16 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.7 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 		 837 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.84 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.85 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.92 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.09 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  30.09 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  27.91 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.09 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.07 
 
 		 236 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 		 576 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 644 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  26.1 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.37 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.44 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  33.88 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.81 
 
 		 329 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.88 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.38 
 
 		 437 aa  42.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.61 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  26.22 
 
 		 657 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>