More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6217 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  89.45 
 
 
478 aa  868    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  90.72 
 
 
474 aa  865    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  90.72 
 
 
474 aa  863    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  89.87 
 
 
478 aa  864    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  90.08 
 
 
485 aa  873    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 
474 aa  961    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  87.53 
 
 
474 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  67.46 
 
 
475 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  99.79 
 
 
474 aa  960    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  89.66 
 
 
478 aa  869    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  89.24 
 
 
485 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  62.23 
 
 
505 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  64.5 
 
 
467 aa  581  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  61.82 
 
 
485 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  62.01 
 
 
463 aa  578  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  62.2 
 
 
476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  64.3 
 
 
560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  64.09 
 
 
571 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  61.56 
 
 
468 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  62.15 
 
 
475 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  62.28 
 
 
475 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  64.09 
 
 
568 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  60.09 
 
 
466 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  60.04 
 
 
474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  62.72 
 
 
482 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  62.37 
 
 
507 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  60.47 
 
 
479 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  61.29 
 
 
474 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  61.47 
 
 
469 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  62.26 
 
 
483 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  62.26 
 
 
483 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  59.4 
 
 
470 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 
480 aa  548  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  59.96 
 
 
478 aa  550  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 
468 aa  548  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  58.1 
 
 
468 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  59.14 
 
 
469 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  58.1 
 
 
468 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  61.17 
 
 
472 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  58.79 
 
 
463 aa  542  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  58.42 
 
 
481 aa  544  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  63.01 
 
 
468 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  60.65 
 
 
481 aa  537  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  60.3 
 
 
471 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  57.76 
 
 
485 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 
478 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  60.43 
 
 
475 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  56.34 
 
 
467 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  59.65 
 
 
468 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  56.8 
 
 
485 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  60.99 
 
 
471 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  59.22 
 
 
468 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  59.22 
 
 
468 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  59.22 
 
 
468 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  63.06 
 
 
479 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  58.33 
 
 
521 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  60.13 
 
 
471 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 
478 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 
478 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  58.8 
 
 
475 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 
480 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  60.09 
 
 
471 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  521  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  57.91 
 
 
483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 
479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 
479 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 
479 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 
472 aa  514  1.0000000000000001e-145  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  59.91 
 
 
471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  56.68 
 
 
483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  59.35 
 
 
474 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  57.02 
 
 
483 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  56.41 
 
 
474 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  56.59 
 
 
483 aa  511  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  58.42 
 
 
540 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  56.93 
 
 
479 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  55.29 
 
 
467 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  59.18 
 
 
468 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0326  aspartate ammonia-lyase  58.57 
 
 
478 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000442883 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  54.55 
 
 
475 aa  503  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  56.68 
 
 
482 aa  502  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
478 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  53.88 
 
 
470 aa  498  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0480  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 
479 aa  499  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0398  aspartate ammonia-lyase  58.57 
 
 
479 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3407  aspartate ammonia-lyase  58.57 
 
 
479 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 
478 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 
478 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 
478 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 
468 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 
478 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3532  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 
479 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.563164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>