More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6185 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1976  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.66 
 
 
687 aa  944    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0310  oxidoreductase, FMN-binding  93 
 
 
686 aa  1323    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019532  hitchhiker  0.00413942 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0743  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.66 
 
 
687 aa  944    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0058  stachydrine utilization oxidoreductase protein  62.79 
 
 
687 aa  917    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.63 
 
 
686 aa  907    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697936  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.23 
 
 
687 aa  897    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467216  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4017  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  80.12 
 
 
686 aa  1153    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  91.4 
 
 
686 aa  1310    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93.73 
 
 
686 aa  1357    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0474  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.66 
 
 
687 aa  944    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4782  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  91.69 
 
 
686 aa  1313    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0707  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.66 
 
 
687 aa  944    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4819  NADH:-lavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.52 
 
 
687 aa  930    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3746  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.54 
 
 
680 aa  697    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0759587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0331  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93 
 
 
686 aa  1323    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907336  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.66 
 
 
687 aa  944    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93.88 
 
 
686 aa  1358    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1003  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.66 
 
 
687 aa  944    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53 
 
 
680 aa  690    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0574  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.52 
 
 
687 aa  900    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5203  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.23 
 
 
687 aa  900    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.94 
 
 
687 aa  939    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789807  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1865  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.95 
 
 
687 aa  946    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.715282  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1582  NADH-flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  64.1 
 
 
687 aa  944    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4897  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93.15 
 
 
686 aa  1326    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616438  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0831  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  63.66 
 
 
687 aa  944    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80.84 
 
 
694 aa  1153    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6185  putative FMN oxidoreductase  100 
 
 
686 aa  1425    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3286  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.37 
 
 
687 aa  902    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  80 
 
 
688 aa  1134    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388153  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5066  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.39 
 
 
687 aa  944    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671736  normal  0.0284931 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.23 
 
 
687 aa  898    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231835  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71260  putative FMN oxidoreductase  98.98 
 
 
686 aa  1414    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.75 
 
 
678 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.37 
 
 
687 aa  902    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4041  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.68 
 
 
680 aa  702    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117135  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.27 
 
 
680 aa  684    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.54 
 
 
680 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  93.29 
 
 
686 aa  1325    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3549  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.79 
 
 
687 aa  898    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.8 
 
 
702 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3207  hypothetical protein  42.86 
 
 
678 aa  558  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.519422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4753  N-methylproline demethylase, putative  42.27 
 
 
678 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1197  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.86 
 
 
678 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.415933  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.13 
 
 
678 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309437  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.98 
 
 
678 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1528  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.78 
 
 
681 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.124714 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.78 
 
 
681 aa  527  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3416  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.21 
 
 
678 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623509  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.67 
 
 
677 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.38 
 
 
686 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5525  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.07 
 
 
686 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215393  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.59 
 
 
684 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3681  putative NADH-dependent oxidase  42.98 
 
 
688 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0197334  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5465  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  39.74 
 
 
690 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663425  normal  0.914634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2254  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.83 
 
 
664 aa  372  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4278  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.61 
 
 
661 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.53 
 
 
650 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.03 
 
 
653 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2869  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.41 
 
 
650 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2820  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.56 
 
 
650 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5721  putative oxidoreductase  32.02 
 
 
648 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65940  putative oxidoreductase  32.02 
 
 
648 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2912  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.98 
 
 
650 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1844  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.78 
 
 
671 aa  308  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71592  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3861  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.48 
 
 
651 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.87 
 
 
646 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.95 
 
 
667 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.59 
 
 
646 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.19 
 
 
665 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.66 
 
 
668 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1488  NADH:flavin oxidoreductase  33.54 
 
 
656 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.69 
 
 
644 aa  283  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.12 
 
 
654 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.34 
 
 
652 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.4 
 
 
725 aa  278  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1455  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.24 
 
 
635 aa  278  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.691445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.02 
 
 
682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.54 
 
 
671 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.95 
 
 
647 aa  273  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5997  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  32.18 
 
 
667 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0797  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.4 
 
 
676 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369713  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.42 
 
 
667 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1303  NADH:flavin oxidoreductase  31.67 
 
 
671 aa  267  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  30.25 
 
 
650 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4819  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.78 
 
 
661 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.17 
 
 
669 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.48 
 
 
711 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.27 
 
 
671 aa  262  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3855  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  30.49 
 
 
672 aa  262  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.25 
 
 
711 aa  262  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.667421  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3142  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.21 
 
 
645 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4931  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.1 
 
 
641 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.28 
 
 
670 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  31.89 
 
 
670 aa  257  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.27 
 
 
711 aa  257  5e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  32.1 
 
 
670 aa  256  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2296  hypothetical protein  30.97 
 
 
674 aa  256  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3539  2,4-dienoyl-CoA reductase  29.06 
 
 
673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  28.96 
 
 
967 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>