More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6155 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  78.32 
 
 
445 aa  679  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  98.4 
 
 
438 aa  855  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  100 
 
 
438 aa  867  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  80.33 
 
 
429 aa  680  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  80.09 
 
 
429 aa  681  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  80.65 
 
 
432 aa  696  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  79.44 
 
 
429 aa  682  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  74.94 
 
 
436 aa  638  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  79.38 
 
 
429 aa  683  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  80.09 
 
 
429 aa  679  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  70.12 
 
 
435 aa  601  1e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  70.07 
 
 
436 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  70.55 
 
 
436 aa  595  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  68.87 
 
 
435 aa  583  1e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  68.82 
 
 
433 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  68.59 
 
 
433 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  68.5 
 
 
466 aa  571  1e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  69.25 
 
 
462 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  68.59 
 
 
433 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  69.25 
 
 
459 aa  563  1e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  69.67 
 
 
466 aa  564  1e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  68.84 
 
 
435 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  69.08 
 
 
461 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  68.84 
 
 
436 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  68.36 
 
 
436 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  68.6 
 
 
436 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  68.84 
 
 
458 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  64.29 
 
 
437 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  68.84 
 
 
458 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  67.06 
 
 
430 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  67.06 
 
 
430 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  67.06 
 
 
430 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  67.06 
 
 
430 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  62.47 
 
 
435 aa  548  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  67.06 
 
 
430 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  66.82 
 
 
465 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  64.29 
 
 
442 aa  538  1e-152  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  66.27 
 
 
445 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 
445 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  64.51 
 
 
442 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  63.82 
 
 
442 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  67.72 
 
 
445 aa  531  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  60.52 
 
 
441 aa  510  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  59.67 
 
 
448 aa  503  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  62 
 
 
447 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  56.18 
 
 
487 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  55.71 
 
 
476 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  55.71 
 
 
476 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  61.98 
 
 
387 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  53.44 
 
 
437 aa  440  1e-122  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  55.72 
 
 
441 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  52.67 
 
 
450 aa  407  1e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  55.21 
 
 
438 aa  400  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  54.22 
 
 
438 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  52.38 
 
 
441 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  46.89 
 
 
436 aa  362  9e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  46.63 
 
 
436 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  46.63 
 
 
436 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  47.94 
 
 
436 aa  358  7e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  51.67 
 
 
441 aa  357  2e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  51.43 
 
 
441 aa  353  3e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  46.29 
 
 
429 aa  353  4e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  43.58 
 
 
432 aa  341  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  51.43 
 
 
441 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  43.19 
 
 
431 aa  325  9e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  39.7 
 
 
443 aa  285  1e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  39.7 
 
 
438 aa  284  2e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  36.96 
 
 
415 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  38.46 
 
 
407 aa  276  5e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  37.73 
 
 
415 aa  273  4e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  31.34 
 
 
433 aa  259  9e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  31.34 
 
 
433 aa  254  1e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 
444 aa  243  4e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
443 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.49 
 
 
443 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  31.36 
 
 
435 aa  229  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  34.84 
 
 
438 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  34.72 
 
 
444 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.61 
 
 
444 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2818  general substrate transporter  31.4 
 
 
483 aa  221  1e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.139895  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0593  major facilitator transporter  31.37 
 
 
457 aa  222  1e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  33.97 
 
 
444 aa  222  1e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.3 
 
 
485 aa  221  2e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  31.96 
 
 
482 aa  221  2e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  31.3 
 
 
485 aa  221  2e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  31.3 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.97213e-11 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  31.3 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  31.3 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.3 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 
438 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  31.3 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  31.3 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  31.3 
 
 
485 aa  220  4e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  34.17 
 
 
438 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  33.17 
 
 
456 aa  219  8e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2233  general substrate transporter  33.5 
 
 
444 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.527639 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  34.89 
 
 
439 aa  217  3e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
438 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1521  major facilitator family transporter  34.43 
 
 
448 aa  213  4e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.537503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  34 
 
 
448 aa  213  4e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>