More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6106 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  313  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  84.42 
 
 
154 aa  277  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  66.89 
 
 
148 aa  207  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  57.58 
 
 
138 aa  160  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.05 
 
 
145 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.95 
 
 
145 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
286 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.55 
 
 
285 aa  139  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  48.94 
 
 
292 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  47.52 
 
 
288 aa  137  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  49.64 
 
 
287 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  54.01 
 
 
149 aa  135  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  51.03 
 
 
149 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  48.55 
 
 
287 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  49.28 
 
 
289 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
287 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  47.1 
 
 
287 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.77 
 
 
289 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.75 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.64 
 
 
153 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
141 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.71 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.32 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.55 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.52 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.7 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  32.45 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.7 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  36.89 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.89 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.32 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  35.58 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  36.54 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  35.58 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  35.58 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  35.58 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  35.58 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  35.58 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  35.58 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.72 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.88 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.14 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  32.17 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.15 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.05 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  33.33 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  36.72 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.72 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  33.33 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.05 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.01 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  33.08 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  33.33 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  33.33 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  33.33 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  29.14 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.94 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.13 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
188 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.62 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.86 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.29 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  30.5 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  31.85 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.28 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  31.47 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  32.62 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>