69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6046 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  56.32 
 
 		 277 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  48.89 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  50.81 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  51.54 
 
 		 180 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  48.84 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  42.86 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  42.75 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  41.18 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  38.37 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  43.75 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  48.84 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  35.78 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  44.12 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  34.35 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  41.18 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  41.57 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  36.62 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  41.73 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  32.84 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  38.61 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  39.23 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  38.52 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  42.65 
 
 		 265 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  39.26 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  34.48 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  38.14 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  32.17 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  31.94 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  42 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  36.67 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  41.3 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  48.15 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  52.38 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1350  hypothetical protein  28.46 
 
 		 131 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  34.19 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0705  hypothetical protein  37.33 
 
 		 119 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00561381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2459  restriction endonuclease-like protein  30.6 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0175776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  39.33 
 
 		 358 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2410  hypothetical protein  24.3 
 
 		 131 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  39.74 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  29.23 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2403  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  47.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.914674  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2577  hypothetical protein  29.13 
 
 		 115 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2644  hypothetical protein  29.13 
 
 		 115 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2752  hypothetical protein  27.73 
 
 		 122 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2835  hypothetical protein  36.11 
 
 		 122 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131961  normal  0.525857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  37.66 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1520  hypothetical protein  36.11 
 
 		 115 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1511  hypothetical protein  36.11 
 
 		 115 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2200  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0235692  hitchhiker  0.00000305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  30.23 
 
 		 266 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  25.86 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1418  hypothetical protein  34.72 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1547  hypothetical protein  34.72 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  27.85 
 
 		 416 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  31.78 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  37.11 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  29.23 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  30.14 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5550  hypothetical protein  30.07 
 
 		 454 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.463025  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1702  hypothetical protein  28.16 
 
 		 122 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  38.57 
 
 		 108 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  32.93 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6708  hypothetical protein  27.87 
 
 		 376 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.292072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>