63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5956 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  297  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  83.56 
 
 		 150 aa  227  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  57.43 
 
 		 149 aa  160  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  40.69 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  41.55 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  41.61 
 
 		 148 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  36.36 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  34.48 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  41.13 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  39.87 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  44.53 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  42.14 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  38.62 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  39.86 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  39.44 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  33.79 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  39.19 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  36.23 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  39.33 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  37.67 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  43.84 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  35.81 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  36.55 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  34.69 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  42.75 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  34.69 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  36.73 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  33.77 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  37.32 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  35.38 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  34.92 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  35.38 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  34.62 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  34.62 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  34.62 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  34.62 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  36 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  36 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  36.51 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  32.62 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  30.46 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  36.17 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  37.16 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  37.3 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  37.3 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  37.3 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  37.3 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  38.71 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  33.58 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  28.1 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  26.53 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  26.53 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  39.06 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  30.2 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  25.17 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>