46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5857 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  92.63 
 
 
190 aa  327  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  60.26 
 
 
206 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  60 
 
 
210 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  52.54 
 
 
207 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  58.49 
 
 
210 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  47.67 
 
 
203 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  38.61 
 
 
173 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  37.34 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  37.66 
 
 
173 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  38.71 
 
 
174 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  34.81 
 
 
182 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  38.12 
 
 
169 aa  99  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  33.52 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  39.22 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  39.19 
 
 
193 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  27.61 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  35.12 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  36.49 
 
 
180 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  28.31 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  28.31 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  33.52 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  30.92 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  28.57 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  33.13 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  29.14 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  32.7 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  32.42 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  29.68 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  33.53 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  26.14 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  30.25 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  30.82 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  29.83 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  29.41 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  28.76 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  28.76 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  26.14 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  29.94 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  26.8 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  29.73 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  23.08 
 
 
171 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>