49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5856 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  89.6 
 
 
173 aa  285  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  57.42 
 
 
169 aa  171  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  55.26 
 
 
188 aa  167  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  50.62 
 
 
180 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  51.55 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  51.32 
 
 
169 aa  149  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  40.65 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  38.75 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  33.53 
 
 
207 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  36.78 
 
 
203 aa  87.8  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  28.14 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  32.39 
 
 
186 aa  84.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  32.39 
 
 
186 aa  84.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  31.93 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  31.65 
 
 
206 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  34.91 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  30.29 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  35.8 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  35.23 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  30.29 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  30.29 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  31.67 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  30.29 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  34.08 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  29.89 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  36.5 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  29.94 
 
 
217 aa  74.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  28.99 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  28.48 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  32.12 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  31.76 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  28.95 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  35.92 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  29.48 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  30.46 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  30.46 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  61.6  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  28.65 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  28.76 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  44.23 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  26.47 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  29.52 
 
 
154 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  27.81 
 
 
208 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>