103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5716 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5716  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65870  hypothetical protein  98.84 
 
 		 258 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  62.26 
 
 		 258 aa  327  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  64.73 
 
 		 260 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  64.32 
 
 		 260 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  34.12 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0201  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2292  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3624  hypothetical protein  33.51 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.78712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2109  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2837  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117714  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2704  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.0872615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26540  hypothetical protein  27.75 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.171066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2252  hypothetical protein  28.94 
 
 		 282 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0330  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.28 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  32.34 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  33.96 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2187  hypothetical protein  26.32 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  28.77 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0840  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  29.9 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0730433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4115  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1240  extracellular solute-binding protein  21.68 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.94 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  32.44 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  32.71 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0459  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.13 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4200  hypothetical protein  26.82 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1997  hypothetical protein  23.77 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  28.1 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1653  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.36 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3772  hypothetical protein  25.91 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.04 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  27.64 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1924  hypothetical protein  24 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.89 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3524  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  26.83 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15200  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 256 aa  52  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2571  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0744474  hitchhiker  0.0010566 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.24 
 
 		 761 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.542463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  31.07 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.54 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  21.4 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0594  hypothetical protein  29.81 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  28.78 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1101  extracellular solute-binding protein family 3  25.23 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0196876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1008  amino acid ABC transporter  24.26 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1910  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.13 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0380327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2873  hypothetical protein  24.62 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0466901  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3738  sensor histidine kinase/response regulator  28.81 
 
 		 917 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.77 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0526  hypothetical protein  20 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.601603  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2624  hypothetical protein  24.44 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.547677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3293  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.55 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0241  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  24.55 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1316  hypothetical protein  27.31 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000283467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1919  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.21 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0371115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1096  UDP-N-acetylmuramate  35.62 
 
 		 475 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  21.15 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  21 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2584  hypothetical protein  24.1 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.685098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  20.19 
 
 		 1301 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1176  extracellular solute-binding protein family 3  25.85 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  26.95 
 
 		 472 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 1255 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  19.34 
 
 		 490 aa  43.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 		 1109 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.35 
 
 		 494 aa  42.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.41 
 
 		 313 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0340  peptidoglycan-binding LysM  23.78 
 
 		 359 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21840  hypothetical protein  25.81 
 
 		 248 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223447  hitchhiker  0.00300338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3395  UDP-N-acetylmuramate  34.25 
 
 		 475 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740162  normal  0.71515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3985  hypothetical protein  23.29 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.817581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.86 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>