41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5692 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  97.88 
 
 
236 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0555  hypothetical protein  51.69 
 
 
232 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  50.42 
 
 
231 aa  231  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0504  hypothetical protein  49.17 
 
 
237 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0320775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4911  hypothetical protein  49.77 
 
 
251 aa  219  2e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4787  hypothetical protein  49.77 
 
 
251 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0600  hypothetical protein  51.12 
 
 
241 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4703  hypothetical protein  48.42 
 
 
236 aa  213  2e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4964  hypothetical protein  48.4 
 
 
214 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340246  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43450  hypothetical protein  49.11 
 
 
242 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  29.85 
 
 
204 aa  75.5  6e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.34 
 
 
201 aa  70.9  2e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  26.53 
 
 
204 aa  67  3e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  26.92 
 
 
212 aa  66.6  3e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.63 
 
 
203 aa  62.8  5e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  25.34 
 
 
205 aa  62.4  6e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  32.38 
 
 
197 aa  60.1  3e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  25.47 
 
 
197 aa  58.5  8e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  24.23 
 
 
198 aa  57.8  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  28.87 
 
 
188 aa  58.2  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.05 
 
 
195 aa  58.2  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  27.75 
 
 
192 aa  56.6  3e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  25.9 
 
 
200 aa  55.5  7e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  24.24 
 
 
196 aa  52  8e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  26.39 
 
 
201 aa  51.2  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1959  hypothetical protein  23.71 
 
 
199 aa  50.4  3e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000996139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  48.5  9e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  25.17 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  25.77 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  26.76 
 
 
196 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.63 
 
 
201 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  28.09 
 
 
202 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  25.67 
 
 
217 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  26.67 
 
 
199 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  23.22 
 
 
211 aa  45.1  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  22.84 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3377  hypothetical protein  25.52 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237475  normal  0.194903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  24.2 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  23.12 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  22.99 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>