More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5556 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  57.49 
 
 
696 aa  796    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  100 
 
 
703 aa  1441    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  57.61 
 
 
696 aa  794    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  59.18 
 
 
703 aa  820    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  59.94 
 
 
692 aa  808    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  60.31 
 
 
703 aa  827    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  61.63 
 
 
701 aa  850    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  61.65 
 
 
709 aa  872    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  95.88 
 
 
708 aa  1389    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  45.57 
 
 
708 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  46.19 
 
 
734 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  44.95 
 
 
710 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  45.24 
 
 
736 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  45.29 
 
 
738 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  42.15 
 
 
711 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  44.33 
 
 
689 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  42.72 
 
 
708 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  43.5 
 
 
710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  43.75 
 
 
732 aa  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  43.98 
 
 
714 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  42.37 
 
 
709 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.04 
 
 
711 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  43.33 
 
 
689 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  41.68 
 
 
741 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  41.49 
 
 
722 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  41.69 
 
 
689 aa  515  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  41.65 
 
 
701 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  41.77 
 
 
730 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  42.92 
 
 
703 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  41.51 
 
 
701 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  41.51 
 
 
701 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 
701 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  41.18 
 
 
701 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  41.04 
 
 
701 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  43.05 
 
 
722 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  39.7 
 
 
722 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  39.94 
 
 
757 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 
715 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 
712 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  38.76 
 
 
701 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 
714 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  37.83 
 
 
724 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  38.2 
 
 
724 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  37 
 
 
723 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 
710 aa  435  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  36.19 
 
 
720 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 
720 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 
720 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
702 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
702 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 
720 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 
715 aa  422  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.43 
 
 
713 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 
720 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
707 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 
860 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  35.88 
 
 
817 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 
864 aa  356  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  34.84 
 
 
699 aa  353  8e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 
862 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 
720 aa  343  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 
726 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 
799 aa  336  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
743 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 
726 aa  336  9e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 
815 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 
825 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
850 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 
837 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 
825 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  33.89 
 
 
843 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  34.43 
 
 
708 aa  320  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  33.01 
 
 
721 aa  319  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  34.75 
 
 
795 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  33.8 
 
 
796 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  34.79 
 
 
795 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
726 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 
707 aa  312  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 
796 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 
698 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 
796 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  33.19 
 
 
796 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  34.26 
 
 
719 aa  300  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  32.9 
 
 
689 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 
689 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  33.09 
 
 
801 aa  297  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 
714 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 
714 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  31.45 
 
 
677 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 
859 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.73 
 
 
821 aa  292  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 
792 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.81 
 
 
833 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.58 
 
 
724 aa  290  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 
730 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
810 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  30.1 
 
 
729 aa  286  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.55 
 
 
700 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 
707 aa  283  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
829 aa  283  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>