More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5512 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  500  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  96.39 
 
 		 249 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  86.69 
 
 		 249 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  83.06 
 
 		 249 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  82.33 
 
 		 249 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  83.13 
 
 		 252 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  81.05 
 
 		 249 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  82.73 
 
 		 249 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  83.13 
 
 		 249 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  82.73 
 
 		 249 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  77.73 
 
 		 221 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  40.8 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  41.54 
 
 		 295 aa  191  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  41.04 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  42.41 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  42.41 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  41.37 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  42.02 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  40.64 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  42.63 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  40.96 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  41.2 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  39.23 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  44.44 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  42.23 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  42.06 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  40.08 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  41.43 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  39.92 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  37.8 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  37.85 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  38.13 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  38.13 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  38.98 
 
 		 254 aa  162  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  38.1 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  37.21 
 
 		 271 aa  158  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  38.31 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  35.69 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  33.33 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  34.12 
 
 		 263 aa  144  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  33.6 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  38.95 
 
 		 199 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  36.7 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  30.52 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  33.19 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  31.8 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  31.49 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  27.45 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.6 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.25 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.69 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.41 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.43 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.62 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  34.65 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.38 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.36 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.43 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.19 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>