More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5477 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  100 
 
 
216 aa  420  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  99.07 
 
 
216 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  67.76 
 
 
219 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  67.76 
 
 
219 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  67.29 
 
 
219 aa  280  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  67.29 
 
 
219 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  65.75 
 
 
223 aa  277  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  66.51 
 
 
223 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  70.7 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  70.7 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  70.7 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  70.7 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  70.7 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  70.7 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  70.7 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  69.63 
 
 
219 aa  262  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  68.22 
 
 
219 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  64.19 
 
 
222 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  63.43 
 
 
222 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  62.33 
 
 
223 aa  258  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  64.68 
 
 
227 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  61.86 
 
 
224 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  61.86 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  63.68 
 
 
216 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  60 
 
 
220 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  58.88 
 
 
218 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  52.65 
 
 
226 aa  214  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  60.38 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.09 
 
 
224 aa  211  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  57.27 
 
 
222 aa  210  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  49.28 
 
 
211 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  47.89 
 
 
225 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  49.04 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  49.04 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  49.04 
 
 
212 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  49.04 
 
 
212 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.04 
 
 
212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  49.04 
 
 
212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  49.04 
 
 
212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  48.56 
 
 
212 aa  197  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  48.84 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  55.81 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  48.56 
 
 
212 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  48.56 
 
 
212 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  48.56 
 
 
212 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  48.56 
 
 
212 aa  194  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  48.56 
 
 
212 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  47.85 
 
 
211 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  44.6 
 
 
226 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  35.58 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  35.58 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  34.63 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.6 
 
 
209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
204 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.1 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.46 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.58 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  33.65 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  36.06 
 
 
211 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 
203 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 
203 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
203 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  30.99 
 
 
213 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  34.45 
 
 
221 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 
217 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.24 
 
 
215 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.52 
 
 
210 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 
217 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.29 
 
 
218 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 
211 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 
218 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.49 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
208 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.02 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
204 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  32.57 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.95 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.39 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.87 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 
204 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  32.85 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.08 
 
 
214 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  31.31 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.38 
 
 
213 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.33 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.33 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>