More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5422 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
255 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  97.65 
 
 
255 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  74.12 
 
 
255 aa  363  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  76.86 
 
 
255 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 
255 aa  357  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  76.86 
 
 
255 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  70.98 
 
 
255 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  69.41 
 
 
255 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  68.63 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  43.15 
 
 
260 aa  204  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  44.88 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  42.08 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 
268 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  47.49 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  41.83 
 
 
260 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  45.2 
 
 
259 aa  195  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  45.63 
 
 
288 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  48.83 
 
 
253 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  45.24 
 
 
288 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  45.63 
 
 
290 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  41.86 
 
 
266 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  43.53 
 
 
260 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  44.84 
 
 
288 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  41.86 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  44.84 
 
 
272 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  45.06 
 
 
274 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  43.6 
 
 
259 aa  188  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  39.61 
 
 
264 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
536 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  43.19 
 
 
266 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  43.19 
 
 
266 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  43.19 
 
 
266 aa  185  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.09 
 
 
270 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  44.05 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  39.09 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  43.36 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  47.13 
 
 
277 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  41.09 
 
 
259 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  45.78 
 
 
258 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  43.92 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
418 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  40.39 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  43.97 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  42.8 
 
 
265 aa  178  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  44.27 
 
 
253 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  39.23 
 
 
262 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  37.21 
 
 
418 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
490 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
293 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  43.19 
 
 
271 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  43.55 
 
 
262 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  41.09 
 
 
424 aa  175  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 
261 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  39.25 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.85 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  42.32 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  42.02 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  41.54 
 
 
258 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  39.3 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 
264 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  39.77 
 
 
267 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  44.22 
 
 
274 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.89 
 
 
455 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  43.5 
 
 
260 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  39.53 
 
 
254 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  38.76 
 
 
255 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 
264 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.46 
 
 
266 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.68 
 
 
405 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  42.31 
 
 
272 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.02 
 
 
254 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  35.52 
 
 
265 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.46 
 
 
262 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  39.53 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  39.53 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.36 
 
 
409 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  33.98 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.41 
 
 
271 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  42.75 
 
 
266 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  43.75 
 
 
266 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  41.98 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  43.2 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  38.64 
 
 
264 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 
255 aa  164  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  42.28 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  39 
 
 
419 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3243  ABC transporter related  44.12 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  37.98 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  43.38 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  42.41 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  39.92 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  38.78 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>