27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5414 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  89.35 
 
 		 259 aa  447  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  59.63 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  59.55 
 
 		 266 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  58.8 
 
 		 267 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  62.03 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  60.45 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  57.41 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  57.3 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  61.35 
 
 		 226 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  79.82 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  45.45 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  47 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  45.54 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  43.9 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  33.96 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  39.47 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  39.77 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  38.64 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  35.48 
 
 		 615 aa  52.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1621  hypothetical protein  36.73 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215267  unclonable  0.000000000374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  41.54 
 
 		 121 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3094  hypothetical protein  33.68 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.779162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  42.55 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2070  MCP methyltransferase, CheR-type with Tpr repeats  34.74 
 
 		 431 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0814478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>