More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5380 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  100 
 
 		 619 aa  1272    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  50.17 
 
 		 593 aa  571  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  47.03 
 
 		 612 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  48.71 
 
 		 615 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  45.14 
 
 		 619 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  46.25 
 
 		 601 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  47.6 
 
 		 610 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  47.06 
 
 		 607 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  46.14 
 
 		 632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  41.48 
 
 		 616 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  45.84 
 
 		 625 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  38.12 
 
 		 616 aa  428  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  38.91 
 
 		 613 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  36.85 
 
 		 615 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  39.47 
 
 		 314 aa  206  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  27.66 
 
 		 593 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.28 
 
 		 607 aa  194  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  24.43 
 
 		 588 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  30.4 
 
 		 815 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  26.5 
 
 		 631 aa  107  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  32.82 
 
 		 708 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  24.28 
 
 		 617 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  25.6 
 
 		 617 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  21.45 
 
 		 827 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  28.1 
 
 		 819 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  23.03 
 
 		 568 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  30 
 
 		 737 aa  87  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  28.1 
 
 		 574 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  22.67 
 
 		 559 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 712 aa  84.3  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.18 
 
 		 711 aa  84  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  23.04 
 
 		 634 aa  82.8  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  31.5 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 		 699 aa  79  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  29.01 
 
 		 752 aa  76.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  26.82 
 
 		 696 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.46 
 
 		 704 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  29.46 
 
 		 704 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 710 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  29.46 
 
 		 704 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  30.27 
 
 		 712 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 705 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  27.8 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  27.97 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  31.64 
 
 		 663 aa  70.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 706 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 		 737 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  27.21 
 
 		 679 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  32.95 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  32.95 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 714 aa  68.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  32.95 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  32.95 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 		 697 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  32.95 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  31.09 
 
 		 768 aa  68.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  28.84 
 
 		 716 aa  68.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  31.11 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 662 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  31.11 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  27.34 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  31.67 
 
 		 720 aa  67.4  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  31.55 
 
 		 625 aa  67  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  31.5 
 
 		 727 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  29.34 
 
 		 717 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  23.11 
 
 		 722 aa  66.2  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  32.4 
 
 		 720 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  25.97 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  28.2 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  27.94 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 603 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  26.09 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  28.2 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 		 671 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  25.23 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 564 aa  64.3  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4099  NERD domain-contain protein  22.36 
 
 		 606 aa  63.9  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 695 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  30.39 
 
 		 724 aa  63.9  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  27.8 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  31.03 
 
 		 744 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  30.77 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  31.84 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  31.03 
 
 		 724 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  28.98 
 
 		 734 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  26.62 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 630 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.03 
 
 		 742 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 723 aa  62  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>