262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5344 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  100 
 
 
264 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  78.06 
 
 
255 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  77.87 
 
 
238 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  73.33 
 
 
218 aa  324  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  65.67 
 
 
240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  65.67 
 
 
240 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  65.67 
 
 
234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  61.4 
 
 
302 aa  304  7e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  61.4 
 
 
235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  60.53 
 
 
235 aa  293  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  58.77 
 
 
235 aa  291  6e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  59.21 
 
 
235 aa  290  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7085  transposase  67.84 
 
 
222 aa  234  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0314847  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  47.84 
 
 
235 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  47.41 
 
 
235 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  47.41 
 
 
235 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  48.96 
 
 
246 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  44.16 
 
 
235 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  50 
 
 
222 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  47.44 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  50.48 
 
 
250 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  47.23 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  47.23 
 
 
250 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  50.48 
 
 
250 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  46.15 
 
 
250 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  46.15 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  49.52 
 
 
346 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.04 
 
 
346 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  44.83 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  45.73 
 
 
246 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  45.32 
 
 
202 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  48.08 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  45.71 
 
 
243 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  46.79 
 
 
228 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  47.17 
 
 
228 aa  181  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  47.17 
 
 
228 aa  181  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  47.83 
 
 
250 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  45.41 
 
 
236 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  46.08 
 
 
228 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.89 
 
 
319 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  49.48 
 
 
224 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  41.58 
 
 
198 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  44.7 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  44.7 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  44.7 
 
 
226 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  45.16 
 
 
226 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  45.75 
 
 
226 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  45.75 
 
 
226 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  45.16 
 
 
226 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  45.75 
 
 
226 aa  172  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  42.06 
 
 
236 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  49.19 
 
 
227 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  44.5 
 
 
212 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  43.72 
 
 
238 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  43.78 
 
 
226 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  45.28 
 
 
226 aa  169  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  44.55 
 
 
226 aa  169  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  44.55 
 
 
226 aa  168  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 
238 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  45.97 
 
 
341 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  44.24 
 
 
226 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  44.24 
 
 
226 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  45.97 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  42.36 
 
 
227 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  43.32 
 
 
236 aa  165  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  45.67 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  42.86 
 
 
214 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  42.38 
 
 
237 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  44.72 
 
 
213 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  42.4 
 
 
224 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  42.4 
 
 
224 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  42.4 
 
 
224 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  42.4 
 
 
224 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.33 
 
 
230 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  41.94 
 
 
224 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 
224 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>