221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5301 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2108  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  48.71 
 
 
782 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2362  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.78 
 
 
797 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2819  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  51.68 
 
 
788 aa  766    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1793  putative fimbriae-related protein  51.13 
 
 
810 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  52.82 
 
 
808 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.218123  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2677  fimbrial usher protein  51.08 
 
 
766 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1446  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  51.66 
 
 
789 aa  756    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61540  hypothetical protein  98.48 
 
 
790 aa  1557    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.675454  normal  0.215257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1802  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.32 
 
 
781 aa  755    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0548904  normal  0.220264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1399  fimbrial usher protein  51.62 
 
 
782 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0477  fimbrial usher family protein  51.62 
 
 
803 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.468363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1614  fimbrial usher protein  51.35 
 
 
803 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1962  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  51.33 
 
 
765 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.120798 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1636  fimbrial usher protein  51.48 
 
 
803 aa  732    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3333  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  50.65 
 
 
797 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5301  hypothetical protein  100 
 
 
790 aa  1580    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2671  fimbrial usher protein  42.61 
 
 
815 aa  624  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1774  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.61 
 
 
815 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.613765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1663  fimbrial usher protein  42.61 
 
 
815 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2459  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  39.67 
 
 
794 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4602  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.23 
 
 
786 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001218  CsuD  36.07 
 
 
804 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0865  fimbrial usher protein  35.84 
 
 
842 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142606  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4395  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.84 
 
 
794 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621063  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03043  signal peptide protein  35.26 
 
 
786 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117793  normal  0.374685 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1220  fimbrial usher protein  35.13 
 
 
803 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2475  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.98 
 
 
748 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1062  P pilus assembly protein, porin PapC  35.13 
 
 
766 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.819207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1069  fimbrial usher protein  35.26 
 
 
766 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0719  fimbrial usher protein  34.87 
 
 
766 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.308044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2294  fimbrial usher protein  34.87 
 
 
766 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2992  fimbrial usher protein  34.87 
 
 
984 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1607  fimbrial usher protein  34.87 
 
 
766 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1268  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.86 
 
 
849 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0271633  normal  0.105864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2341  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.26 
 
 
816 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5759  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.83 
 
 
785 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01136  outer membrane usher protein FasD  34.17 
 
 
783 aa  346  8e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0354539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1921  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.68 
 
 
775 aa  346  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.22 
 
 
834 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0007  outer membrane usher protein, putative  30.6 
 
 
814 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0008  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.6 
 
 
807 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.333359  hitchhiker  0.00375796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1270  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.2 
 
 
790 aa  291  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.465422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0144  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.75 
 
 
791 aa  281  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0778  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  30.21 
 
 
778 aa  260  7e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.243314  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2693  putative outer membrane usher transmembrane protein  28.86 
 
 
754 aa  258  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513198 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0610  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.87 
 
 
798 aa  229  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000874993  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0304  fimbrial biogenesis protein  26.28 
 
 
788 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0342  putative outer membrane usher protein fimD  26.2 
 
 
765 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2057  fimbrial biogenesis protein  27.01 
 
 
834 aa  179  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000165922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0535  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  26.61 
 
 
734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3599  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.02 
 
 
778 aa  121  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3740  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.81 
 
 
778 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.53 
 
 
778 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25.31 
 
 
837 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0764  hypothetical protein  24.78 
 
 
840 aa  85.9  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6324  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.08 
 
 
830 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.08 
 
 
830 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0990  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.33 
 
 
833 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  25.75 
 
 
872 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  25 
 
 
836 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0185038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  25 
 
 
840 aa  71.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0607  outer membrane usher protein fimD  24.22 
 
 
869 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0594926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00482  predicted outer membrane export usher protein  24.09 
 
 
869 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03011  predicted outer membrane protein  27.57 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0561  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.57 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02962  hypothetical protein  27.57 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3626  fimbrial usher family protein  27.57 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00487  hypothetical protein  24.09 
 
 
869 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4462  fimbrial usher family protein  27.57 
 
 
863 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0577  outer membrane usher protein SfmD  24.19 
 
 
869 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.5582  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3336  fimbrial usher family protein  27.57 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.559371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0633  outer membrane usher protein SfmD  24.17 
 
 
869 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.770244  normal  0.392496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0331  outer-membrane fimbrial usher protein  24.44 
 
 
836 aa  68.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0554  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  27.57 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0981109  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.28 
 
 
1040 aa  68.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.84 
 
 
828 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3090  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.01 
 
 
869 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.832581  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2406  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.03 
 
 
812 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0338  outer-membrane fimbrial usher protein  24.12 
 
 
836 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.200021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.75 
 
 
852 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.69 
 
 
875 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.69 
 
 
875 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3081  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  23.75 
 
 
867 aa  64.3  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  25.22 
 
 
868 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0330  outer-membrane fimbrial usher protein  23.51 
 
 
836 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.361792 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1548  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.5 
 
 
826 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.2778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0934  fimbrial usher protein  21.76 
 
 
826 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.33 
 
 
851 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  22.26 
 
 
876 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1538  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.5 
 
 
826 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  21.9 
 
 
883 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0194  outer membrane usher protein FimD  27.91 
 
 
848 aa  62  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.931496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2399  fimbrial usher protein  21.76 
 
 
826 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  21.9 
 
 
883 aa  62  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2245  fimbrial usher protein  21.59 
 
 
826 aa  61.6  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.141315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0207  outer membrane usher protein FimD  27.33 
 
 
848 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  24.76 
 
 
852 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4882  outer membrane fimbrial usher protein  22.78 
 
 
814 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405826 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  28.35 
 
 
870 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  21.29 
 
 
826 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>