182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5270 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  98.94 
 
 
568 aa  1148    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  100 
 
 
568 aa  1155    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  29.61 
 
 
599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 
561 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 
561 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.05 
 
 
561 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.49 
 
 
559 aa  154  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.14 
 
 
587 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.57 
 
 
561 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.57 
 
 
561 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  24.37 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.86 
 
 
561 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  25.1 
 
 
597 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  25 
 
 
559 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.96 
 
 
569 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  25.09 
 
 
551 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  25.09 
 
 
551 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  25.09 
 
 
551 aa  145  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  25.09 
 
 
551 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  25.71 
 
 
569 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  24.8 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.54 
 
 
569 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.8 
 
 
551 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  26.38 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.59 
 
 
572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  28.25 
 
 
550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  28.04 
 
 
624 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  26.32 
 
 
558 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.75 
 
 
578 aa  130  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.37 
 
 
592 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.04 
 
 
554 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  25.79 
 
 
554 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.33 
 
 
554 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  26.58 
 
 
607 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.58 
 
 
747 aa  123  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  28.21 
 
 
587 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  26.17 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  24.57 
 
 
588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.3 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.73 
 
 
607 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.61 
 
 
548 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.62 
 
 
592 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  27.69 
 
 
553 aa  121  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.75 
 
 
572 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.27 
 
 
554 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26 
 
 
567 aa  120  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  24.9 
 
 
584 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.98 
 
 
552 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.42 
 
 
692 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  25.09 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.67 
 
 
589 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.69 
 
 
585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.19 
 
 
554 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.61 
 
 
581 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.61 
 
 
581 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.79 
 
 
586 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  27.06 
 
 
556 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  27.8 
 
 
545 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  25.95 
 
 
544 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.25 
 
 
560 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  25.73 
 
 
544 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  24 
 
 
565 aa  103  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.57 
 
 
592 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  25.05 
 
 
585 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.98 
 
 
553 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.66 
 
 
588 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.2 
 
 
579 aa  99  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  24.41 
 
 
531 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.76 
 
 
558 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  24.28 
 
 
557 aa  96.3  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  22.75 
 
 
567 aa  95.5  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  22.75 
 
 
567 aa  95.5  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  24.85 
 
 
531 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.53 
 
 
561 aa  95.9  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.81 
 
 
575 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  22.95 
 
 
558 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  23.16 
 
 
442 aa  94.7  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  22.75 
 
 
567 aa  94.4  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.24 
 
 
567 aa  94  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  25.15 
 
 
595 aa  94  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.54 
 
 
1349 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.64 
 
 
1391 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  26.78 
 
 
582 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.91 
 
 
561 aa  90.1  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.31 
 
 
546 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  25.19 
 
 
583 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.37 
 
 
590 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.79 
 
 
595 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.62 
 
 
545 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.48 
 
 
576 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.48 
 
 
580 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.67 
 
 
585 aa  87.4  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  25.31 
 
 
583 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.3 
 
 
585 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  22.47 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  25.1 
 
 
569 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.44 
 
 
565 aa  83.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  22.5 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  25.41 
 
 
595 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.42 
 
 
1570 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>