45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5220 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0678  hypothetical protein  72.47 
 
 
620 aa  920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0709  hypothetical protein  72.14 
 
 
617 aa  913    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.740824  normal  0.0355501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5220  hypothetical protein  100 
 
 
618 aa  1261    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1197  hypothetical protein  74.19 
 
 
617 aa  925    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168598  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60580  hypothetical protein  96.28 
 
 
618 aa  1217    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.73851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0710  hypothetical protein  72.14 
 
 
617 aa  917    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0398425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4507  hypothetical protein  72.01 
 
 
617 aa  932    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766692  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4871  hypothetical protein  70.87 
 
 
617 aa  926    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40880  hypothetical protein  70.97 
 
 
620 aa  891    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4261  hypothetical protein  70.23 
 
 
617 aa  910    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.965638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4587  hypothetical protein  69.9 
 
 
617 aa  897    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2797  hypothetical protein  40.87 
 
 
619 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3342  hypothetical protein  39.32 
 
 
622 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2201  hypothetical protein  39.01 
 
 
629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2920  hypothetical protein  38.47 
 
 
648 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1333  hypothetical protein  38.14 
 
 
625 aa  320  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0538  hypothetical protein  33.77 
 
 
631 aa  309  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0544605  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1998  hypothetical protein  33.33 
 
 
600 aa  309  8e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000836402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0551  hypothetical protein  33.39 
 
 
630 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000916398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2382  hypothetical protein  36.07 
 
 
642 aa  273  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000248399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0050  hypothetical protein  35.66 
 
 
665 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0248559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0062  hypothetical protein  34.98 
 
 
668 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0046  hypothetical protein  34.72 
 
 
664 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2012  hypothetical protein  33.9 
 
 
678 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0047  hypothetical protein  37.47 
 
 
645 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.384755 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2037  hypothetical protein  30.29 
 
 
718 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0513  hypothetical protein  27.54 
 
 
670 aa  218  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.975602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1756  hypothetical protein  29.32 
 
 
720 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3811  hypothetical protein  28.28 
 
 
636 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0654806  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3805  hypothetical protein  26.54 
 
 
615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1465  hypothetical protein  25.33 
 
 
618 aa  144  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1790  hypothetical protein  25.85 
 
 
598 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304981  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0106  hypothetical protein  32.22 
 
 
653 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00855  hypothetical protein  27.21 
 
 
623 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00443533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06072  hypothetical protein  27.21 
 
 
623 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00242349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5024  hypothetical protein  32.5 
 
 
653 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01810  hypothetical protein  27.52 
 
 
664 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.925728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0165  hypothetical protein  25.3 
 
 
648 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72110  hypothetical protein  26.22 
 
 
652 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0201799  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6262  hypothetical protein  26.22 
 
 
652 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5469  hypothetical protein  32.5 
 
 
653 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4438  hypothetical protein  29.59 
 
 
651 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0149  hypothetical protein  27.84 
 
 
651 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0167  hypothetical protein  27.84 
 
 
648 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.753668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5078  hypothetical protein  27.37 
 
 
652 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>