More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5206 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  100 
 
 
406 aa  811    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  86.42 
 
 
405 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  99.01 
 
 
406 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  81.73 
 
 
406 aa  631  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  80.3 
 
 
407 aa  614  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  80.79 
 
 
407 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  81.94 
 
 
408 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  81.94 
 
 
408 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  81.68 
 
 
408 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  79.12 
 
 
408 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  78.57 
 
 
407 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  66.67 
 
 
397 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  64.05 
 
 
402 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.55 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  66.96 
 
 
347 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  66.67 
 
 
390 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  66.67 
 
 
390 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  66.67 
 
 
390 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  63.29 
 
 
391 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  66.47 
 
 
392 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  61.31 
 
 
395 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  63.28 
 
 
341 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  63.28 
 
 
341 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  63.69 
 
 
392 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  63.14 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  63.14 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  62.86 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  63.14 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  63.14 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  63.14 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0476  GTPase ObgE  62.19 
 
 
390 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000104171  normal  0.949161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  62.57 
 
 
392 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  64.24 
 
 
387 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.57 
 
 
390 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  62.43 
 
 
345 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  63.77 
 
 
389 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  65.77 
 
 
390 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  62.57 
 
 
390 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  59.39 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  59.13 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  64.78 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  59.4 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  62.5 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  64.56 
 
 
390 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  62.87 
 
 
395 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  63.17 
 
 
397 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03048  GTPase involved in cell partioning and DNA repair  62.86 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00301118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02999  hypothetical protein  62.86 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0026544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  64.07 
 
 
386 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0517  GTPase ObgE  62.86 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000402809  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  64.37 
 
 
339 aa  398  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3376  GTPase ObgE  62.86 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000688776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3668  GTPase ObgE  62.86 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000139354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3479  GTPase ObgE  62.86 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000528393  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3587  GTPase ObgE  62.86 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000763921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  62.06 
 
 
345 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  61.68 
 
 
391 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  62.1 
 
 
346 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  64.07 
 
 
339 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.18 
 
 
356 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  63.39 
 
 
364 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  62.79 
 
 
353 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  63.1 
 
 
364 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  58.18 
 
 
370 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3649  GTPase ObgE  65.77 
 
 
388 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  61.13 
 
 
379 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0897  GTPase ObgE  60.98 
 
 
388 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00842399  normal  0.946957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3123  GTPase ObgE  60.98 
 
 
388 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  64.86 
 
 
388 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  60.17 
 
 
357 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3217  GTPase ObgE  60.98 
 
 
388 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000011291  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  62.04 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  63.61 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  62.04 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  62.04 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  63.61 
 
 
370 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  62.04 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  60.23 
 
 
392 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  60.99 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  62.04 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  62.04 
 
 
372 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0969  GTPase ObgE  63.66 
 
 
389 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00013573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  60.56 
 
 
366 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1038  GTPase ObgE  63.66 
 
 
389 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000432526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3321  GTPase ObgE  63.66 
 
 
389 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000481857  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1071  GTPase ObgE  63.66 
 
 
389 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00003897  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00802  GTPase ObgE  61.38 
 
 
391 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  60.22 
 
 
357 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.23 
 
 
371 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  62.28 
 
 
373 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2925  GTPase ObgE  63.66 
 
 
388 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  61.88 
 
 
397 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0268  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.99 
 
 
375 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0981  GTPase ObgE  64.26 
 
 
388 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00015516  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  60.65 
 
 
373 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  60.65 
 
 
370 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2827  GTPase ObgE  59.89 
 
 
389 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00452464  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  60.42 
 
 
361 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  58.76 
 
 
362 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  64.2 
 
 
370 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>