213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5176 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  69.22 
 
 		 545 aa  733    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 586 aa  1176    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  51.58 
 
 		 585 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  51.97 
 
 		 550 aa  522  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  49.57 
 
 		 607 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  53.28 
 
 		 583 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  48.41 
 
 		 553 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.04 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.83 
 
 		 554 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  37.37 
 
 		 554 aa  333  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  36.91 
 
 		 556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.2 
 
 		 569 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.07 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  33.52 
 
 		 548 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.3 
 
 		 561 aa  251  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.72 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.6 
 
 		 567 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.35 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.62 
 
 		 595 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  30.86 
 
 		 575 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  29.98 
 
 		 567 aa  192  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  29.98 
 
 		 567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  29.98 
 
 		 567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  29.41 
 
 		 576 aa  186  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  31.31 
 
 		 442 aa  184  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.38 
 
 		 590 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.97 
 
 		 571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.16 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 596 aa  170  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  29.55 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.92 
 
 		 545 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.98 
 
 		 747 aa  167  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.81 
 
 		 692 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.38 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  30.4 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  27.7 
 
 		 581 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.48 
 
 		 567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  27.85 
 
 		 568 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  27.85 
 
 		 568 aa  123  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  24.7 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  25.09 
 
 		 692 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  25.65 
 
 		 597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  26.93 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  26.93 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.83 
 
 		 561 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  27.16 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  26.76 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  25.97 
 
 		 584 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.75 
 
 		 558 aa  104  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.2 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.76 
 
 		 592 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26 
 
 		 560 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  24.11 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  26.54 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  26.13 
 
 		 562 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.76 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.5 
 
 		 581 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.5 
 
 		 581 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  23.77 
 
 		 558 aa  94  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  24.43 
 
 		 570 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.07 
 
 		 588 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  25.93 
 
 		 558 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  24.04 
 
 		 595 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.6 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24.78 
 
 		 608 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.06 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.09 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.89 
 
 		 553 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.84 
 
 		 585 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.44 
 
 		 554 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  25.44 
 
 		 574 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.05 
 
 		 599 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  29.06 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.53 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  24.24 
 
 		 588 aa  84.7  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.77 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  21.71 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  26.71 
 
 		 607 aa  84  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  21.89 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  21.71 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  21.71 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  21.71 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.48 
 
 		 543 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  21.71 
 
 		 559 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.03 
 
 		 562 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.29 
 
 		 538 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.99 
 
 		 568 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.03 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.03 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  21.71 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.4 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.38 
 
 		 560 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.69 
 
 		 561 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.83 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.48 
 
 		 554 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.57 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.55 
 
 		 562 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  22.6 
 
 		 565 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>