64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5151 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  100 
 
 
169 aa  336  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  59.86 
 
 
177 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  46.99 
 
 
198 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  42.68 
 
 
201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  45 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1679  phage prohead protease, HK97 family  44.14 
 
 
189 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000321389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  41.22 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  41.22 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  41.22 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  41.22 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  38.86 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  41.33 
 
 
220 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  41.33 
 
 
220 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  41.89 
 
 
196 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  41.89 
 
 
196 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  40.4 
 
 
194 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2599  HK97 family phage prohead protease  36.31 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00442603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  32.65 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1683  phage phi-105 ORF26-like protein  35.95 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  35.43 
 
 
562 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2474  phage prohead protease, HK97 family  37.82 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  34.27 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1458  phage prohead protease, HK97 family  29.58 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4383  prohead protease  31.49 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  31.25 
 
 
506 aa  68.2  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4980  prophage LambdaBa03, prohead protease  34.19 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5359  prophage LambdaBa03, prohead protease  34.19 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  28.57 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  31.33 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  30.92 
 
 
231 aa  55.5  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08240  phage prohead protease, HK97 family  29.09 
 
 
190 aa  54.3  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00758613  hitchhiker  0.00429473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  32.31 
 
 
220 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  34.06 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3715  HK97 family phage prohead protease  27.68 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3766  HK97 family phage prohead protease  27.68 
 
 
221 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  30.77 
 
 
235 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  31.16 
 
 
240 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  29.17 
 
 
228 aa  51.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  30.32 
 
 
222 aa  50.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  30.32 
 
 
222 aa  50.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  33.59 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  32.31 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  32.56 
 
 
215 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  31.82 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  29.93 
 
 
219 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  35.94 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  34.42 
 
 
250 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  30.15 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  30.66 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  30.43 
 
 
248 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  27.7 
 
 
171 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2150  peptidase U35, phage prohead HK97  27.34 
 
 
233 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  34.11 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  33.09 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  31.33 
 
 
233 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2636  HK97 family phage prohead protease  31.2 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00090927  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  30.94 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  33.33 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  29.1 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  31.39 
 
 
183 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  30.53 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  27.78 
 
 
187 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  27.7 
 
 
228 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  30.07 
 
 
579 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>