More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5143 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 404 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  56.68 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  46.84 
 
 		 429 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  42.76 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  36.84 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  29.7 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  30.6 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  51.68 
 
 		 188 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  33.12 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.02 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.66 
 
 		 402 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  32.87 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  35.69 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1997  site specific recombinase  33.33 
 
 		 279 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  29.62 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  34.68 
 
 		 251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  43.23 
 
 		 172 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  34.04 
 
 		 275 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  41.72 
 
 		 159 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  30.61 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  32.11 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  32.11 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  32.67 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.94 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.5 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  34.29 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  29.02 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  38.61 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  37.74 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.03 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  33.06 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  31.1 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.23 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  28.91 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 444 aa  106  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  43.62 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.11 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  33.2 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 451 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  26.59 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  41.03 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  38.62 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  26.79 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.87 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  41.84 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  31.87 
 
 		 407 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  30.54 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  29.22 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  29.22 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  29.22 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  30.54 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  29.22 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  25.79 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  24.7 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  28.36 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  28.74 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  28.52 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.26 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  25.24 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  24.7 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  24.58 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  24.58 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  37.93 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  27.38 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  30.29 
 
 		 341 aa  94.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.96 
 
 		 387 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  35.81 
 
 		 334 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.95 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  23.99 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  39.22 
 
 		 381 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  30.68 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  29.22 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  24.64 
 
 		 412 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  25.3 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  30.52 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  38.17 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  30.52 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  30.39 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  39.04 
 
 		 334 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  33.15 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  34.51 
 
 		 222 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  25.41 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  26.3 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  26.3 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  32.78 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 304 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.49 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.26 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.36 
 
 		 377 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>