More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5121 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5121  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58500  hypothetical protein  96.67 
 
 
210 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5673  lysine exporter protein LysE/YggA  62.25 
 
 
211 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1998  amino acid efflux pump, RhtB family protein  52.68 
 
 
213 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.457454  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5050  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 
218 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.637848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4774  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  48.6 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0100683  hitchhiker  0.00129257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0369  lysine exporter protein LysE/YggA  47.64 
 
 
208 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177582  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4987  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3086  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  47.12 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98662  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0506  lysine exporter protein LysE/YggA  54.73 
 
 
205 aa  171  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3439  lysine exporter protein LysE/YggA  45.31 
 
 
207 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.783726 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4641  lysine exporter protein LysE/YggA  45.83 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5170  lysine exporter protein LysE/YggA  45.31 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.44 
 
 
209 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5636  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.32 
 
 
211 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0625165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0810  LysE family protein  47.37 
 
 
241 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87054  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0610  LysE family protein  47.37 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2117  LysE family protein  46.84 
 
 
208 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2203  LysE family translocator protein  47.37 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.987401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  38.92 
 
 
211 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.81 
 
 
208 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 
210 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  38.54 
 
 
203 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  41.87 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.93 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1569  LysE family protein  46.84 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2032  LysE family translocator protein  46.84 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0712  LysE family translocator protein  46.84 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.767088  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  39.49 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  39.79 
 
 
210 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.58 
 
 
209 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3884  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.32 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 
215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5819  lysine exporter protein LysE/YggA  38.73 
 
 
215 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4996  lysine exporter protein LysE/YggA  39 
 
 
243 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.27 
 
 
210 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  39.51 
 
 
212 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  43.07 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4385  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  0.231735 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  39.3 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5581  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.65 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 
210 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
204 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.12 
 
 
210 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  36.97 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  38.46 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.62 
 
 
210 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
204 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
204 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  37.13 
 
 
204 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0612  RhtB family transporter  37.98 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1369  lysine exporter protein LysE/YggA  37.82 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459986  normal  0.11161 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.16 
 
 
211 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  37.07 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  36.36 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  36.63 
 
 
204 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.59 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.42 
 
 
205 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.59 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.54 
 
 
204 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.13 
 
 
211 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.02 
 
 
211 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 
218 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  37.32 
 
 
210 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.13 
 
 
218 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.02 
 
 
211 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.35 
 
 
206 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.02 
 
 
211 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  37.17 
 
 
206 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  36.54 
 
 
212 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  35.15 
 
 
215 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  34.5 
 
 
213 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 
209 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 
209 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  33.97 
 
 
210 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  36.63 
 
 
194 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.74 
 
 
224 aa  104  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  36.63 
 
 
194 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  33.98 
 
 
223 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  36.63 
 
 
194 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>