147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5081 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  96 
 
 		 310 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  63.4 
 
 		 297 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  63.02 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  62.26 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  62.64 
 
 		 297 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  63.91 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  51.19 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  53.85 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  54.13 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  51.05 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  47.49 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  48.84 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  48.29 
 
 		 260 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  48.29 
 
 		 260 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  50 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  50.78 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  47.14 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  48.36 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  49.61 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  49.61 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  49.57 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  45.1 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  40.76 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  44.8 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  40.07 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  50.43 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  40.51 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  43.3 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  45.74 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  43.14 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  42.97 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  43.66 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  37 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  43.92 
 
 		 264 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  38.95 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  36.53 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  40.94 
 
 		 270 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  40.5 
 
 		 246 aa  152  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  41.39 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  38.6 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  40.81 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  38.6 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  43.23 
 
 		 273 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  42.65 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  37.74 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  37.4 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  37.35 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  40.49 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  40.08 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  37.45 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  40.89 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  40.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  36.76 
 
 		 268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  39.62 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  39.62 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  41.11 
 
 		 285 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  39.62 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  42.06 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  37.31 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  43.59 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  39.86 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  43.28 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  36.23 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  37.04 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  31.72 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  38.4 
 
 		 244 aa  99.4  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  33.82 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  38.36 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  30.64 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  28.36 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  32.68 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  29.06 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  32.43 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  32.39 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  28.51 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  29.27 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  30.83 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  29.8 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0009  zinc/iron permease  36.18 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.288224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  33.18 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  33.18 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  33.18 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  33.18 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  33.18 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  34.1 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  33.03 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  32.46 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  30.62 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  32.17 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  29.63 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  29.69 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>