28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4833 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4833  putative type II secretion system protein  100 
 
 		 191 aa  370  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  85.26 
 
 		 213 aa  310  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  46.6 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2205  type II secretion system protein J  40.72 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0654355  normal  0.781056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1064  Type II secretory pathway component PulJ  28.82 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00786562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0056  putative general secretion pathway protein J  29.34 
 
 		 231 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2778  general secretory pathway protein J  28.74 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2669  general secretory pathway protein J  28.74 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0015  general secretion pathway protein J  28.74 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0015  general secretion pathway protein J  28.74 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1883  general secretory pathway protein J  28.74 
 
 		 242 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3511  general secretory pathway protein J  29.94 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0227  general secretory pathway protein J  28.74 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0074  putative general secretion pathway protein J  29.94 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3237  putative general secretion pathway protein J  28.14 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.722967  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0014  general secretory pathway protein J  27.54 
 
 		 242 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3387  Type II secretory pathway component PulJ  28.65 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0055  putative general secretion pathway protein J  27.98 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0954003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0045  putative general secretion pathway protein J  27.98 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  23.83 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  39.47 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  37.5 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  39.47 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4494  putative general secretory pathway protein J  26.55 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.13576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3077  putative general secretory pathway protein J  26.44 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000785542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3943  putative general secretory pathway protein J  25.84 
 
 		 228 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.173018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3224  general secretory pathway J transmembrane protein  27.32 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>