102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4771 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4771  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54600  hypothetical protein  97.07 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0220314  normal  0.0306544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2034  VanW  70.63 
 
 		 290 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5507  VanW family protein  48.04 
 
 		 277 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.170032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3002  vancomycin B-type resistance protein VanW  47.76 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2239  vancomycin B-type resistance protein VanW  47.06 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00319629  hitchhiker  0.00000191747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0598  VanW family protein  40.55 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1773  VanW family protein  39.25 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11841  hypothetical protein  42.21 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_002950  PG0532  hypothetical protein  45.66 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1663  VanW family protein  30.71 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4437  VanW family protein  33.08 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2386  VanW  31.68 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  35.48 
 
 		 600 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3243  lipoprotein  32.33 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00100446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3641  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3548  VanW-related protein  32.33 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0578688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3327  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0016973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3291  lipoprotein  32.09 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.012504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3588  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.54706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3236  VanW family protein  29.41 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3551  putative lipoprotein  32.33 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1676  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0114871  decreased coverage  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3542  putative lipoprotein  32.09 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81276e-32 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3002  VanW family protein  34.4 
 
 		 591 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2217  VanW family protein  30.83 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0075  VanW family protein  31.94 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3560  VanW family protein  33.58 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  35.04 
 
 		 781 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1638  VanW  31.82 
 
 		 436 aa  72.4  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0777  VanW family protein  33.04 
 
 		 456 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1436  VanW family protein  27.04 
 
 		 474 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2263  VanW family protein  27.92 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1493  VanW family protein  33.04 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1933  VanW family protein  38.33 
 
 		 633 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945976  hitchhiker  0.000000296122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0917  VanW family protein  32.54 
 
 		 491 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.361573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0198  VanW family protein  31.75 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3683  VanW family protein  28.57 
 
 		 489 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206654  hitchhiker  0.000681281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1062  VanW  26.74 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2665  VanW family protein  33.08 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000623276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3060  VanW family protein  28.16 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1099  VanW family protein  26.47 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0429527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1106  VanW family protein  29.55 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000710478  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0472  hypothetical protein  31.54 
 
 		 510 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  32.73 
 
 		 670 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  31.41 
 
 		 675 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0642  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.85 
 
 		 420 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4696  vancomycin B-type resistance protein VanW  28.85 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000301625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0513  vancomycin b-type resistance protein  33.33 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0515  vancomycin b-type resistance protein  33.33 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.50262e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1178  VanW family protein  31.86 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0832  VanW family protein  32.14 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0518  VanW family protein  33.62 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1613  VanW family protein  30.52 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0632012  normal  0.156067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3246  VanW family protein  31.58 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0694  copper amine oxidase-like  33.61 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351561  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0423  VanW family protein  27.23 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0036  VanW family protein  33.61 
 
 		 636 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1593  VanW  31.93 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.620025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2042  VanW family protein  29.77 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  28 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1300  VanW family protein  26.57 
 
 		 491 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00126458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1452  VanW family protein  27.21 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88765  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1227  VanW family protein  29.59 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2734  VanW  30.3 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1310  vanW-like family protein  27.83 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0768  VanW family protein  32.77 
 
 		 636 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.865985  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0522  VanW family protein  32.14 
 
 		 417 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1124  VanW family protein  28.79 
 
 		 582 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0405605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0964  hypothetical protein  28.68 
 
 		 419 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1520  vanW-like family protein  27.83 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.516908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2468  VanW family protein  26.19 
 
 		 579 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1161  VanW family protein  26.47 
 
 		 580 aa  55.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5187  VanW family protein  26.36 
 
 		 576 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19490  uncharacterized vancomycin resistance protein  28.68 
 
 		 682 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0459635  decreased coverage  0.00355972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0907  hypothetical protein  27.42 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1358  hypothetical protein  26.92 
 
 		 319 aa  52.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2332  VanW  35.29 
 
 		 450 aa  52.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4059  VanW family protein  35.71 
 
 		 642 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.40506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26060  uncharacterized vancomycin resistance protein  33.33 
 
 		 765 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0879  VanW family protein  29.25 
 
 		 580 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0796  VanW family protein  25.95 
 
 		 847 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.823779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1251  hypothetical protein  26.95 
 
 		 591 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1302  VanW family protein  35 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3554  VanW family protein  28.7 
 
 		 748 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.650443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0147  VanW family protein  28.12 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28220  uncharacterized vancomycin resistance protein  28.4 
 
 		 550 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8063  vancomycin resistance protein- like protein  30.12 
 
 		 690 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.470172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0398  VanW family protein  27.52 
 
 		 620 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151032  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1933  VanW family protein  28.95 
 
 		 567 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3975  VanW family protein  24.55 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000476767  unclonable  0.000000000108609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1823  hypothetical protein  23.98 
 
 		 569 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3234  VanW family protein  28.24 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1577  VanW family protein  28.1 
 
 		 738 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4452  VanW family protein  27.43 
 
 		 559 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>