129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4667 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  98.46 
 
 		 389 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  100 
 
 		 388 aa  798    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  48.85 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  50.77 
 
 		 390 aa  381  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  47.7 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  54.77 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  51.5 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  49.02 
 
 		 429 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  41.55 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.38 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  43.56 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  36.91 
 
 		 400 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  40.59 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  38.74 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  38.5 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  42.44 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  32.56 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  35.84 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  38.86 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.66 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  31.74 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.54 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  31.97 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  32.16 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  29.71 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.48 
 
 		 491 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  34.4 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  40.61 
 
 		 212 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.27 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.63 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.94 
 
 		 481 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.2 
 
 		 481 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.94 
 
 		 481 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.94 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.44 
 
 		 481 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 534 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  35.48 
 
 		 223 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.64 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  30.73 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  29.15 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  29.15 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  29.28 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  29.28 
 
 		 408 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  29.15 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.41 
 
 		 497 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  33.17 
 
 		 362 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.28 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  31.96 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.39 
 
 		 473 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  27.98 
 
 		 235 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.67 
 
 		 491 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  31.82 
 
 		 222 aa  93.2  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 276 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  32.32 
 
 		 201 aa  89.7  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.4 
 
 		 485 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  33.33 
 
 		 487 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  38.76 
 
 		 197 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  30.54 
 
 		 220 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  32.37 
 
 		 221 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  32.37 
 
 		 221 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  31.68 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  31.68 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  31.68 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  31.68 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  31.68 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  31.68 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  31.68 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.75 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.29 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 216 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.14 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.84 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.84 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.39 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.39 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.39 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.39 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  30.33 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.77 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  30.74 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  56.25 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  28.29 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  64.58 
 
 		 972 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  27.59 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 211 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  34.59 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  29.33 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>