193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4666 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  98.07 
 
 
207 aa  416  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71 
 
 
205 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  66 
 
 
204 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  64.85 
 
 
204 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.38 
 
 
191 aa  196  2e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.79 
 
 
193 aa  188  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.64 
 
 
192 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  47.64 
 
 
201 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.94 
 
 
216 aa  180  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.68 
 
 
192 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.07 
 
 
193 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  40.31 
 
 
192 aa  163  2e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.02 
 
 
191 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.83 
 
 
192 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.32 
 
 
507 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.86 
 
 
195 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.1 
 
 
192 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.36 
 
 
507 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
192 aa  139  4e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.74 
 
 
192 aa  138  5e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
192 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
197 aa  117  2e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 
189 aa  112  4e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
197 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
193 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.98 
 
 
191 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.65 
 
 
194 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.91 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.38 
 
 
191 aa  99  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.38 
 
 
191 aa  99  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.55 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.85 
 
 
191 aa  97.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.32 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.85 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.38 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.38 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  28.65 
 
 
189 aa  91.7  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.67 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  1.99345e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.25 
 
 
193 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.57 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  40.57 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.25 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.25 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.57 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.24 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.57 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  40.57 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  40.57 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 
194 aa  84.3  1e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.44 
 
 
192 aa  83.6  2e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
199 aa  82  6e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.10916e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.21 
 
 
197 aa  80.9  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
192 aa  80.1  2e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.42 
 
 
200 aa  78.6  6e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 
195 aa  78.2  8e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.71 
 
 
194 aa  77.8  1e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
199 aa  77.4  1e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.65 
 
 
193 aa  76.6  3e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 
195 aa  76.6  3e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
200 aa  75.5  6e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.94 
 
 
198 aa  75.5  6e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
194 aa  73.9  2e-12  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  31.69 
 
 
198 aa  73.6  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
196 aa  73.6  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.65 
 
 
192 aa  72.8  3e-12  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  29.95 
 
 
211 aa  72  6e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  29.33 
 
 
213 aa  70.1  2e-11  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
196 aa  70.1  2e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.17 
 
 
230 aa  70.5  2e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.58 
 
 
196 aa  70.5  2e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25 
 
 
194 aa  69.7  3e-11  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.38 
 
 
218 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.98 
 
 
206 aa  68.6  7e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.97 
 
 
197 aa  68.2  8e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 
233 aa  68.2  9e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.42 
 
 
197 aa  67  2e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.78 
 
 
198 aa  65.5  6e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0109  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
223 aa  65.5  6e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0238  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  21.16 
 
 
193 aa  64.3  1e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000322122  hitchhiker  7.73634e-09 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.58 
 
 
195 aa  63.9  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.7 
 
 
197 aa  63.9  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.12 
 
 
195 aa  63.5  2e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0837  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.33 
 
 
199 aa  63.2  3e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.19 
 
 
196 aa  62.4  4e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.58 
 
 
256 aa  62.8  4e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.17 
 
 
199 aa  62  6e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.94 
 
 
194 aa  61.6  8e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.94 
 
 
206 aa  60.1  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  30.56 
 
 
195 aa  59.3  4e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.29 
 
 
263 aa  59.3  4e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.29 
 
 
197 aa  59.3  4e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  33.64 
 
 
203 aa  58.9  5e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
222 aa  58.9  6e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
198 aa  58.2  8e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2450  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.16 
 
 
199 aa  57.8  1e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  0.966087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.16 
 
 
261 aa  57.4  1e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>