299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4532 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  458  1e-128  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  96.88 
 
 
224 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  87.5 
 
 
224 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  87.95 
 
 
224 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  86.61 
 
 
224 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  87.5 
 
 
228 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  86.16 
 
 
224 aa  400  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  84.75 
 
 
226 aa  397  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  86.55 
 
 
230 aa  399  1e-110  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  85.2 
 
 
229 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  82.96 
 
 
224 aa  367  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  68.61 
 
 
224 aa  327  1e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  70.91 
 
 
229 aa  325  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.53404e-08  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  70.14 
 
 
229 aa  324  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  70.91 
 
 
223 aa  322  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  70.72 
 
 
225 aa  319  2e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  68.44 
 
 
232 aa  316  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  67.12 
 
 
224 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  66.67 
 
 
224 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  65.92 
 
 
225 aa  314  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  74.77 
 
 
224 aa  314  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  66.52 
 
 
227 aa  312  3e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  65.77 
 
 
224 aa  311  7e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  66.06 
 
 
228 aa  309  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  66.52 
 
 
227 aa  308  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  66.06 
 
 
228 aa  308  4e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  67.73 
 
 
221 aa  308  6e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  64.86 
 
 
230 aa  306  1e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  65.16 
 
 
226 aa  307  1e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  64.41 
 
 
230 aa  305  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  65.33 
 
 
235 aa  302  2e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  69.23 
 
 
224 aa  301  5e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  67.73 
 
 
233 aa  300  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  66.37 
 
 
226 aa  293  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  58.3 
 
 
226 aa  293  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  65 
 
 
232 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  58.56 
 
 
244 aa  291  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  65.92 
 
 
237 aa  290  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  65.47 
 
 
237 aa  290  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  62.56 
 
 
229 aa  288  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  62.56 
 
 
229 aa  288  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  63.51 
 
 
225 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  63.51 
 
 
225 aa  286  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  63.39 
 
 
246 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  62.17 
 
 
244 aa  286  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  63.8 
 
 
228 aa  282  2e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  62.44 
 
 
223 aa  278  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.26628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  63.23 
 
 
230 aa  276  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  61.99 
 
 
228 aa  275  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  59.11 
 
 
228 aa  272  3e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  58.77 
 
 
241 aa  268  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  60.44 
 
 
229 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  57.26 
 
 
256 aa  265  3e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  59.09 
 
 
236 aa  261  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  56.82 
 
 
230 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  57.71 
 
 
234 aa  259  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  59.56 
 
 
233 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  55.79 
 
 
259 aa  258  5e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  60 
 
 
234 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  55.79 
 
 
285 aa  256  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  59.56 
 
 
234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  60 
 
 
234 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  56.7 
 
 
224 aa  250  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  58.3 
 
 
237 aa  249  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  56.11 
 
 
227 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  55.66 
 
 
233 aa  241  4e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  56.89 
 
 
227 aa  239  3e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.8435e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  53.36 
 
 
222 aa  236  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  52.94 
 
 
222 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  52.02 
 
 
227 aa  234  1e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  54.34 
 
 
233 aa  231  8e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  52.49 
 
 
230 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0300  exsB protein  60.56 
 
 
208 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.495784  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  50.66 
 
 
229 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  48.87 
 
 
225 aa  214  1e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  48.87 
 
 
225 aa  213  2e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  51.58 
 
 
226 aa  212  4e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  47.2 
 
 
224 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  47.09 
 
 
229 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  47.14 
 
 
224 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  49.77 
 
 
229 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  50.23 
 
 
226 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  46.67 
 
 
224 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  47.03 
 
 
224 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  46.26 
 
 
229 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  44.8 
 
 
225 aa  197  1e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  43.89 
 
 
225 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  49.31 
 
 
231 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  46.43 
 
 
222 aa  182  4e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  45.29 
 
 
220 aa  177  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  44.89 
 
 
221 aa  173  1e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  44.25 
 
 
251 aa  174  1e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  42.92 
 
 
243 aa  171  7e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  39.73 
 
 
484 aa  169  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  43.5 
 
 
227 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2961  exsB protein  40.62 
 
 
218 aa  166  3e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  44.2 
 
 
226 aa  165  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  42.41 
 
 
221 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  44.2 
 
 
226 aa  164  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  40.62 
 
 
218 aa  163  2e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>