80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4369 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4369  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  256  5e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  91.41 
 
 
128 aa  236  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  5.82925e-06 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  53.91 
 
 
119 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  47.58 
 
 
135 aa  114  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  50.43 
 
 
121 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  52.1 
 
 
123 aa  112  2e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  52.17 
 
 
127 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  52.17 
 
 
127 aa  110  7e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  49.57 
 
 
123 aa  107  7e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  49.57 
 
 
129 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  43.31 
 
 
131 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  48.7 
 
 
134 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  41.18 
 
 
132 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1073  hypothetical protein  43.86 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  35.61 
 
 
133 aa  75.1  3e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  68.6  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  37.14 
 
 
132 aa  67.4  7e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  42.53 
 
 
143 aa  65.5  2e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  36.07 
 
 
132 aa  64.3  6e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  34.59 
 
 
143 aa  63.2  1e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  38.24 
 
 
140 aa  62.4  2e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  37.25 
 
 
137 aa  61.6  4e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  26.5 
 
 
143 aa  60.8  7e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  37.17 
 
 
132 aa  59.7  1e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  37.38 
 
 
138 aa  58.9  3e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  29.25 
 
 
124 aa  57.8  4e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.9 
 
 
138 aa  57  9e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  36.45 
 
 
138 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  36.45 
 
 
138 aa  56.6  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  31.07 
 
 
130 aa  56.6  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  36.9 
 
 
136 aa  57  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  36.9 
 
 
144 aa  56.6  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  32.67 
 
 
136 aa  56.2  1e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  37.63 
 
 
138 aa  56.6  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  34.62 
 
 
137 aa  54.7  4e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  32 
 
 
132 aa  54.3  5e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  32 
 
 
132 aa  53.9  8e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  33.65 
 
 
137 aa  53.5  9e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.17 
 
 
144 aa  53.1  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  29.51 
 
 
149 aa  53.1  1e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  26.67 
 
 
129 aa  53.1  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  33.86 
 
 
148 aa  52.4  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  33.65 
 
 
137 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  29.66 
 
 
133 aa  52  3e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  26.5 
 
 
141 aa  51.2  5e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  31.06 
 
 
145 aa  50.8  7e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  33.96 
 
 
132 aa  49.7  1e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  31.2 
 
 
141 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.37 
 
 
137 aa  49.3  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.32 
 
 
132 aa  48.1  4e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  37.65 
 
 
120 aa  47  8e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  31.62 
 
 
125 aa  47  9e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  32.33 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  28.07 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  26.8 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  31.73 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.3 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  27.16 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  31.36 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  31.52 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  26.74 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  31.82 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  25 
 
 
140 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.44 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  29.36 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.25 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  31.3 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>