More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4338 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  55.41 
 
 
231 aa  225  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  57.83 
 
 
230 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  57.83 
 
 
230 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  58.26 
 
 
230 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  55.22 
 
 
230 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  57.56 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.25 
 
 
239 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 
264 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  38.59 
 
 
239 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.58 
 
 
240 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 
499 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  42.67 
 
 
367 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  48.15 
 
 
350 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  48.15 
 
 
350 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  50.94 
 
 
219 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  46.51 
 
 
352 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  46.92 
 
 
330 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.88 
 
 
607 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  43.42 
 
 
342 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  49.57 
 
 
337 aa  100  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  45.38 
 
 
242 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
218 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  48.12 
 
 
344 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  49.06 
 
 
218 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  45.08 
 
 
375 aa  99  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  48.72 
 
 
337 aa  98.2  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  47.17 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 
376 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.37 
 
 
344 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  45.67 
 
 
333 aa  95.9  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  47.71 
 
 
266 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.37 
 
 
344 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  53.4 
 
 
230 aa  95.5  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.37 
 
 
344 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 
345 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  44.36 
 
 
351 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 
218 aa  94  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  46.51 
 
 
344 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  41.41 
 
 
319 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  50.49 
 
 
334 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  48.11 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  48.11 
 
 
214 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  47.71 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  45.86 
 
 
345 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.43 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  46.02 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  48.25 
 
 
348 aa  92.8  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  41.01 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 
344 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.02 
 
 
429 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  46.51 
 
 
344 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.98 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.98 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  45.28 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.95 
 
 
294 aa  91.3  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.47 
 
 
228 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  49.06 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  34.29 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  48.62 
 
 
296 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  42.14 
 
 
362 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 
333 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  32.84 
 
 
212 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  49.51 
 
 
321 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  49.04 
 
 
327 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  41.3 
 
 
319 aa  89  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  46.73 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  48.48 
 
 
355 aa  88.6  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  47.79 
 
 
178 aa  88.6  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 
263 aa  88.6  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  42.03 
 
 
319 aa  88.2  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.84 
 
 
466 aa  88.2  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  48.54 
 
 
226 aa  88.2  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  39.62 
 
 
168 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  45.28 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  41.04 
 
 
331 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  48.51 
 
 
319 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  60.29 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  45.28 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  30.97 
 
 
294 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.81 
 
 
375 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  43.4 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  47.17 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
1755 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  40.17 
 
 
509 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 
375 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  42.45 
 
 
159 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>