More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4297 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
462 aa  927    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  94.81 
 
 
462 aa  890    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  64.07 
 
 
438 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  48.38 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  48.21 
 
 
451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  47.52 
 
 
440 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  47.97 
 
 
443 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  48.06 
 
 
442 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  47.01 
 
 
441 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  42.67 
 
 
410 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  39.96 
 
 
442 aa  319  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  42.37 
 
 
437 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  42.37 
 
 
437 aa  317  4e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  42.86 
 
 
405 aa  317  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  42.52 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  40.73 
 
 
407 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 
399 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.87 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.87 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  41.59 
 
 
398 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  40.13 
 
 
420 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  40.34 
 
 
414 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  40.13 
 
 
414 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  40.13 
 
 
414 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  40.13 
 
 
414 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  37.07 
 
 
401 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  40.82 
 
 
398 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  39.96 
 
 
418 aa  292  7e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
413 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
413 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
413 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
413 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
413 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
413 aa  289  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  39.7 
 
 
413 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  38.53 
 
 
413 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.18 
 
 
430 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  39.58 
 
 
454 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  39.05 
 
 
413 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  37.72 
 
 
398 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  39.48 
 
 
413 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  40.13 
 
 
414 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  39.57 
 
 
402 aa  280  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  39.27 
 
 
404 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  39.66 
 
 
406 aa  279  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.39 
 
 
395 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  39.52 
 
 
413 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  39.7 
 
 
425 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  39.52 
 
 
413 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  37.2 
 
 
402 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  37.2 
 
 
402 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  39.52 
 
 
413 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  38.48 
 
 
453 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  36.11 
 
 
401 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  39.16 
 
 
453 aa  277  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  38.03 
 
 
425 aa  276  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  37.92 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
453 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  38.31 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  38.02 
 
 
453 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  38.64 
 
 
453 aa  272  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  38.01 
 
 
410 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 
395 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  34.57 
 
 
458 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.77 
 
 
400 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 
402 aa  269  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  37.55 
 
 
400 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  37.21 
 
 
455 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  37.71 
 
 
453 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  37.71 
 
 
453 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  37.71 
 
 
453 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 
461 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  37.92 
 
 
453 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  36.53 
 
 
538 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  37.05 
 
 
459 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.24 
 
 
423 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  36.27 
 
 
453 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.63 
 
 
426 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 
453 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.19 
 
 
418 aa  256  7e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  40.43 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  35.64 
 
 
402 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 
399 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  37.09 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  36.44 
 
 
413 aa  243  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  35.55 
 
 
401 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  35.55 
 
 
401 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.19 
 
 
435 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  34.54 
 
 
413 aa  240  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  35.33 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  35.33 
 
 
402 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  36.61 
 
 
417 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  35.12 
 
 
401 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  34.56 
 
 
383 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  35.27 
 
 
402 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  34.59 
 
 
415 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 
407 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.9 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>