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for query gene PSPA7_4280 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.69 
 
 		 1173 aa  842    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.75 
 
 		 1191 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 		 1190 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  40.3 
 
 		 1193 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  61.58 
 
 		 1165 aa  1376    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 		 1198 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 		 1192 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  66.38 
 
 		 1177 aa  1632    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  100 
 
 		 1171 aa  2344    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  61.58 
 
 		 1165 aa  1376    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  50.63 
 
 		 1694 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  42.69 
 
 		 1188 aa  1009    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  46.14 
 
 		 1187 aa  815    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  50.56 
 
 		 1359 aa  864    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  57.29 
 
 		 1759 aa  958    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 		 1162 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 		 1213 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.85 
 
 		 968 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  40.88 
 
 		 968 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 		 974 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  40.35 
 
 		 965 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  37.9 
 
 		 905 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  28.55 
 
 		 733 aa  201  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 		 602 aa  196  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 765 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 1486 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 746 aa  189  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.52 
 
 		 731 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 632 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 709 aa  181  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 709 aa  181  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 958 aa  179  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 1275 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 1509 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 1067 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 1152 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 1152 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 625 aa  164  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 625 aa  164  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  29.32 
 
 		 1182 aa  164  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 		 393 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.86 
 
 		 610 aa  162  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 832 aa  160  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 734 aa  158  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  27.25 
 
 		 988 aa  158  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 625 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 723 aa  154  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 635 aa  154  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  38.85 
 
 		 721 aa  153  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 1991 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 539 aa  152  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 684 aa  152  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.23 
 
 		 1561 aa  151  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  38.66 
 
 		 717 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 658 aa  147  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  23.8 
 
 		 1334 aa  146  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 531 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 		 717 aa  145  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 617 aa  145  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 		 775 aa  144  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 		 670 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 551 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 		 652 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 880 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.09 
 
 		 1644 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 		 576 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.09 
 
 		 1644 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 		 526 aa  140  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 662 aa  139  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 		 710 aa  139  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.29 
 
 		 996 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 653 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 728 aa  136  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 		 551 aa  136  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 		 555 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  27.02 
 
 		 810 aa  135  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  24.4 
 
 		 783 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 		 684 aa  132  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 308 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.08 
 
 		 809 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 808 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 794 aa  130  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 586 aa  128  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 556 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 783 aa  127  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 725 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
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NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 2046 aa  126  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
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NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 725 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
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NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 796 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
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NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  25.05 
 
 		 958 aa  123  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.75 
 
 		 853 aa  122  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 742 aa  121  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 729 aa  121  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 784 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  32.45 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 		 732 aa  119  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 		 851 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
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NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.72 
 
 		 851 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.72 
 
 		 851 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  29.72 
 
 		 851 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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