More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4127 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4127  putative transcriptional regulator  100 
 
 
294 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47880  putative transcriptional regulator  97.22 
 
 
288 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000178644  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3678  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 
284 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1800  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.18 
 
 
284 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.744174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0656  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
284 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3628  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
283 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5014  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
283 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3353  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
283 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5273  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
283 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4427  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
283 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
284 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 
284 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  31.14 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 
309 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
322 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2337  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
296 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 
322 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
294 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 
322 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
283 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
296 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
283 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
290 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2824  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
284 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1020  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
297 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0278  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
303 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0006  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3936  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
315 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0006  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
282 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0276  transcriptional regulator, LysR family protein  28.67 
 
 
287 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00160059  hitchhiker  0.0000019997 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  33.45 
 
 
332 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 
290 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
291 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0014  transcriptional regulator  27.56 
 
 
282 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000122814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
292 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
281 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
298 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 
289 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2226  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
294 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0492432  normal  0.299524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 
301 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
296 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2149  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
294 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269804  normal  0.274984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.49 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  30.63 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 
293 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0258  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
289 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
299 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
295 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 
285 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05533  transcriptional regulator  28.57 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4760  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
296 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 
299 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
284 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 
290 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 
292 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1114  putative transcriptional regulator  35.13 
 
 
301 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  31.48 
 
 
287 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
292 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 
309 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 
291 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  30.21 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6042  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.957083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
298 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
288 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3532  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
288 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
283 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0258  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.061034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>