More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4019 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  62.45 
 
 		 812 aa  1035    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  57.45 
 
 		 843 aa  924    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  64.15 
 
 		 839 aa  1080    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  100 
 
 		 816 aa  1660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  98.04 
 
 		 813 aa  1597    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  40.3 
 
 		 709 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  39.78 
 
 		 849 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 738 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  33.24 
 
 		 755 aa  312  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 697 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 751 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 746 aa  305  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  32.15 
 
 		 733 aa  305  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  31.24 
 
 		 732 aa  303  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 726 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 726 aa  295  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 726 aa  295  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 732 aa  294  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 817 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 808 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 808 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 809 aa  273  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  28.97 
 
 		 723 aa  266  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 764 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 742 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  29.45 
 
 		 723 aa  253  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 704 aa  248  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 783 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 718 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 745 aa  240  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 745 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  29.97 
 
 		 771 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 745 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 725 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  28.44 
 
 		 717 aa  235  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 725 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 725 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 701 aa  233  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 725 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 701 aa  231  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 723 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 723 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 723 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 723 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  28.69 
 
 		 714 aa  215  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 710 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 721 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 716 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  27.4 
 
 		 721 aa  210  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  28.71 
 
 		 713 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  27.39 
 
 		 704 aa  207  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 698 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 728 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 739 aa  174  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.39 
 
 		 713 aa  172  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 716 aa  170  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 724 aa  158  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 753 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  33.45 
 
 		 332 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  23.56 
 
 		 801 aa  105  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.8 
 
 		 861 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 792 aa  98.6  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  24.81 
 
 		 764 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 787 aa  92  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  30.59 
 
 		 739 aa  89.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.98 
 
 		 750 aa  88.2  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 797 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 807 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.73 
 
 		 706 aa  87.4  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.73 
 
 		 706 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.5 
 
 		 764 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.73 
 
 		 706 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  22.92 
 
 		 821 aa  86.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 828 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  24.11 
 
 		 828 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.59 
 
 		 721 aa  84.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1000 aa  84.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 828 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.59 
 
 		 706 aa  84  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 828 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 		 959 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 844 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  22.95 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 809 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 715 aa  80.9  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 1020 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 700 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 799 aa  79.7  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 700 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.61 
 
 		 690 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 864 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>